François Rousseu

Professionnel de recherche
Statistiques et programmation R


Bureau D8-1066
Université de Sherbrooke
2500, boulevard de l'Université
Sherbrooke, QC, J1K 2R1

Cell: (873) 989-1974


GitHub: https://github.com/frousseu 

Formation - Présentation - Exemples - Publications

FORMATION
  • M.Sc. Écologie, Influence de la structure du paysage sur la territorialité du Colibri à gorge rubis, 2010 (Université de Sherbrooke)
  • B.Sc. Biologie, 2007 (Université du Québec à Rimouski)
  • Techniques d'écologie appliquée, 2005 (Cégep de Sherbrooke)

PRÉSENTATION

Au cours de ma maîtrise dans le labo de Marc Bélisle, j'ai développé un fort intérêt pour tout ce qui touche à l'analyse de données et à la programmation avec R. Les millions de lignes de données générées par les visites des colibris aux abreuvoirs m'ont forcé à apprendre R afin de faciliter le traitement de données et l'automatisation des tâches. Depuis ce temps, mon principal intérêt en tant que biologiste est de relever les défis associés à l'analyse quantitative de données écologiques. Comment pourrait-on analyser ce jeu de données? Comment représenter numériquement telle variable? Pourrais-je programmer ceci afin d'automatiser cette tâche? Comment illustrer ces résultats? Voilà des questions que je trouve stimulantes.

Ayant débuté mes études en biologie en raison d'une passion pour les oiseaux, depuis le début de ma maîtrise j'ai surtout travaillé en lien avec la faune aviaire comme contractuel pour le Service canadien de la faune (SCF). J'ai notamment travaillé sur la sélection d'habitat par l'Oie des neiges, les densités d'oiseaux pélagiques par échantillonnage par distance (distance sampling), la phénologie de nidification des oiseaux au Canada  (Outil de requête des calendriers de nidification ) et la réalisation d'outils interactifs spatiaux (R et Shiny) en lien avec les urgences environnementales. Au cours de ces travaux, j'ai également travaillé sur divers packages R (rNest ,GeoAviR, ECSASconnect), utilisé Shiny , GitHub , LaTeX , etc. et j'ai réalisé la très grande majorité de mes tâches spatiales avec R. Même si la plupart de mes expériences sont avec les oiseaux, je suis bien évidemment ouvert à travailler sur n'importe quel projet touchant de près ou de loin à l'écologie!

En bref, n'hésitez pas à me contacter si vous avez des questions en lien avec:

  • Les statistiques et l'analyse de données (simulations, méthodes Monte Carlo, modélisation, etc.)
  • Le traitement de données (lecture de fichiers txt, mise en forme de base données, calculs de valeurs compliquées, etc.)
  • Programmation R et création de package
  • Les tâches spatiales avec R
  • Production de graphiques complexes (ou pas)
  • Production de rapports automatisés (knitr , markdown , LaTeX )
  • Création d'application Shiny 
EXEMPLES
PUBLICATIONS ET COMMUNICATIONS

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Formations et Écoles

Summer School in Evolutionary Ecology and Biology 2024 
Pedagogical coordinator is Adam Ali.
24 juin - 3 juillet 2024
Campus Triolet, Montpellier, France

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