Guillaume de Lafontaine

Postdoctorat
Biogeographic and genomic admixture analysis of a progenitor-derivative spruce species pair
Chaire de recherche du Canada en génomique forestière et environnementale
Institut de biologie intégrative et des systèmes
Pavillon C.E. Marchand, 1030 avenue de la médecine
Université Laval
Québec (Québec) G1V 0A6, Canada

Directeur: Jean Bousquet

Intérêts de recherche

Mes travaux visent à développer et employer des approches interdisplinaires alliant écologie végétale, paléoécologie et génétique des populations pour aborder des problématiques fondamentales et appliquées (e.g., conservation) en biogéographie terrestre.

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Formation universitaire et recherche postdoctorale

Attestation d’étude de 1er cycle (en cours depuis 2013)
Programme court en développement de logiciels, Unité d’enseignement et de recherche Science et Technologie, TÉLUQ, Université du Québec

Postdoctorat (en cours depuis 2012)
Biogeographic and genomic admixture analysis of a progenitor-derivative spruce species pair, Chaire de recherche du Canada en génomique forestière et environnementale,Institut de biologie intégrative et des systèmes, Centre d'étude de la forêt, Université Laval, Québec. Supervision: Jean Bousquet

2010-2012 Postdoctorat
To beech or not to beech: integrating genetics and palaeoecology to uncover late Quaternary history of European beech at its warm distribution edge. Unité mixte de recherche Biodiversité Gènes et Communautés (BioGeCo), INRA & Université Bordeaux 1, Bordeaux, France. Supervision: Rémy J. Petit 

2005-2010 Doctorat (PhD biologie)
Origine holocène et dynamique récente des pessières d’épinette blanche et des sapinières subalpines dans l’est du Canada. Département de biologie, Université Laval, Québec. Supervision: Serge Payette 

2003-2004 Maîtrise (MSc biologie)
Richesse spécifique le long d’un gradient de production: utilisation d’une approche multivariée. Département de biologie, Université Laval, Québec. Supervision: Gilles Houle


Encadrement d’étudiants

Warren E. (2015) Phylogéographie du mélèze laricin (Larix laricina [Du Roi] K. Koch) en Amérique du Nord. Maîtrise. Université Laval. (direction: Jean Bousquet)

Cinget B. (2014) Étude phylogéographique pancanadienne du sapin baumier (Abies balsamea [L.] Mill.) et de ses relations avec le sapin subalpin (Abies lasiocarpa [Hook] Nutt.) dans l’ouest du Canada. Doctorat. Université Laval. (direction: Jean Bousquet)

Amasifuen Guerra, C.A. (2012) Historical Distribution of European beech (Fagus sylvatica L.) in southwestern France: Evidence from macrofossil soil charcoal analysis. Master 2. Université Bordeaux 1.

Amasifuen Guerra,C.A. (2011) Conservation et variabilité spatiale locale des macrofossiles de charbon de bois dans les hêtraies du sud-ouest de la France. Master 1. Université Bordeaux 1.

Lefèvre, S. (2010) Diversité et structure génétique des populations de hêtre (Fagus sylvatica) en limite sud d’aire de répartition. Master 2. Université Bordeaux 1. (co-direction: Rémy J. Petit)


Publications avec comité de lecture

P20. Warren, E., de Lafontaine, G., Gérardi, S., Senneville, S., Beaulieu, J., Perron, M., Jaramillo-Correa, J.-P., Bousquet, J. (sous presse) Joint inferences from cytoplasmic DNA and fossil data provide evidence for glacial vicariance and contrasted postglacial dynamics in tamarack, a transcontinental conifer. Journal of Biogeography.

P19. de Lafontaine, G., Prunier, J., Gérardi, S., Bousquet, J. (2015) Tracking the progression of speciation: variable patterns of introgression across the genome provide insights on the species delimitation between progenitor-derivative spruces (Picea mariana × P. rubens). Molecular Ecology, 24, 5229–5247. PDF 

P18. Sitzia, L., Bertran, P., Bahain, J.-J., Bateman, M.D., Hernandez, M., Garon, H., de Lafontaine, G., Mercier, N., Leroyer, C., Queffelec, A., Voinchet, P. (sous presse) The Quaternary coversands of southwest France. Quaternary Science Reviews, 124, 84-105. PDF 

P17. Cinget, B., de Lafontaine, G., Gérardi, S., Bousquet, J. (2015) Integrating phylogeography and paleoecology to investigate the origin and dynamics of hybrid zones: insights from two widespread North American firs. Molecular Ecology, 24, 2856-2870. PDF 

P16. de Lafontaine, G., Amasifuen Guerra, C.A., Ducousso, A., Sánchez-Goñi, M.F. & Petit, R.J. (2014) Beyond skepticism: uncovering cryptic refugia using multiple lines of evidence. New Phytologist, 204, 450-454. PDF 

P15. de Lafontaine, G., Amasifuen Guerra, C.A., Ducousso, A. & Petit, R.J. (2014) Cryptic no more: soil fossil charcoal uncovers Pleistocene forest microrefugia within a periglacial desert. New Phytologist, 204, 715-729. PDF 

P14. Gavin, D.G., Fitzpatrick, M.C., Gugger, P.F., Heath K.D., Rodríguez-Sánchez, F., Dobrowski, S.Z., Hampe, A., Hu, F.S., Ashcroft, M.B., Bartlein, P.J., Blois, J.L., Carstens, B.C., Davis, E.B., de Lafontaine, G., Edwards, M.E., Fernandez, M., Henne, P.D., Herring, E.M., Holden, Z.A., Kong, W.-S., Liu, J., Magri, D., Matzke, N.J., McGlone, M.S., Saltré, F., Stigall, A.L., Tsai Y.H.E., Williams, J.W. (2014) Climate refugia: joint inferences from fossil records, species distribution models, and phylogeography. New Phytologist, 204, 37-54. PDF 

P13. de Lafontaine, G., Ducousso, A., Lefèvre, S., Magnanou, E. & Petit, R.J. (2013) Stronger spatial genetic structure in recolonized areas than in refugia in the European beech. Molecular Ecology, 22, 4397-4412.PDF 

P12. de Lafontaine, G., Amasifuen Guerra, C.A. & Ducousso, A. (2013) L’anthracothèque de Bordeaux: une collection de référence pour l’identification taxonomique des charbons de bois macrofossiles provenant des Landes de Gascogne et leur périphérie. Bulletin de la Société Linnéenne de Bordeaux, 148, 241-248.PDF 

P11. de Lafontaine, G. & Payette, S. (2012) How climate and fire disturbances influence contrasted dynamics of Picea glauca alpine tree lines in Atlantic and continental eastern North America. Ecotones between forest and grassland (ed. by R.W. Myster), chapter 13: 299-312. Springer, New York. PDF 

P10. de Lafontaine, G. & Asselin, H. (2012) Soil charcoal stability over the Holocene — Response to comments by Mikael Ohlson. Quaternary Research, 78, 155-156. PDF 

P9. Lefèvre, S., Wagner, S., Petit, R.J. & de Lafontaine, G. (2012) Multiplex kits of microsatellite markers for genetic studies of beech. Molecular Ecology Resources, 12, 484-491. PDF 

P8. de Lafontaine, G. & Payette S. (2012) Long-term fire and forest history of subalpine balsam fir (Abies balsamea) and white spruce (Picea glauca) stands in eastern Canada inferred from soil charcoal analysis. The Holocene, 22, 191-201. PDF 

P7. de Lafontaine, G., Couillard, P.-L. & Payette S. (2011) Permineralization of soil macrofossil charcoal promotes preservation of palaeoecological information. Journal of Quaternary Science, 26, 571-575. PDF 

P6. de Lafontaine, G. & Asselin, H. (2011) Soil charcoal stability over the Holocene across boreal northeastern North America. Quaternary Research, 76, 196-200. PDF 

P5. de Lafontaine, G. & Payette, S. (2011) Shifting zonal patterns of the southern boreal forest in eastern Canada associated with changing fire regime during the Holocene. Quaternary Science Reviews, 30, 867-875. PDF 

P4. de Lafontaine, G. & Payette, S. (2010) The origin and dynamics of subalpine white spruce and balsam fir stands in boreal eastern North America. Ecosystems, 13, 932-947. PDF 

P3. de Lafontaine, G., Turgeon, J. & Payette, S. (2010) Phylogeography of white spruce (Picea glauca) in eastern North America reveals contrasting ecological trajectories. Journal of Biogeography, 37, 741-751. PDF 

P2. de Lafontaine, G. & Houle, G. (2007) Species richness along a production gradient: a multivariate approach. American Journal of Botany, 94, 79-88. PDF 

P1. de Lafontaine, G. (2005) Protocole de suivi des populations d'aster du Saint-Laurent, Symphyotrichum laurentianum, aux îles-de-la-Madeleine. Canadian Field-Naturalist, 119, 556-568. PDF 


Autres publications

A11. de Lafontaine, G. (2014) Analyse des charbons de bois. Chronostratigraphie et distribution spatiale des dépôts éoliens quaternaires du bassin aquitain (auteur: L. Sitzia), page 35. Thèse de doctorat, Université de Bordeaux, Bordeaux.

A10. de Lafontaine, G. (2012) Shifting zonal patterns of the southern boreal forest in eastern Canada associated with changing fire regime during the Holocene (abstract XVIII INQUA Congress). Quaternary International, 279, 110.

A9. de Lafontaine, G., Jones, M.T. & Willey, L.L. (2012) Monts Otish, Québec. Eastern Alpine Guide. (ed. by M.T. Jones & L.L. Willey), chapter 19: 261-272. Beyond Ktaadn, Inc. & Boghaunter Books, New Salem, Massachusetts. PDF 

A8. de Lafontaine, G., Hermanutz, L., Anions, M., Siegwart Collier, L., Goren, J., Jones, M.T. & Willey, L.L. (2012) Other alpine sites on the Canadian shield. Eastern Alpine Guide. (ed. by M.T. Jones & L.L. Willey), chapter 21: 285-302.Beyond Ktaadn, Inc. & Boghaunter Books, New Salem, Massachusetts. PDF 

A7. Ducousso, A., Barbedienne, P., Corcket E., Guinberteau, J., de Lafontaine, G., Lefèvre, S. & Timbal, J. (2012) Le hêtre dans les plaines du Sud-Ouest. Sud-Ouest Nature. SEPANSO, Bordeaux,154, 12-13. PDF 

A6. de Lafontaine, G., Lefèvre S., Ducousso, A., Petit R.J. & Magnanou, E. (2011) Structure génétique des populations de hêtre (Fagus sylvatica) des Pyrénées orientales et Catalogne. Rapport scientifique, Travaux de la Massane no 94. Réserve naturelle nationale de la Massane (RNN6), Laboratoire Arago, Banyuls sur Mer, 12 p.

A5. de Lafontaine, G. (2010) Origine holocène et dynamique récente des pessières d’épinette blanche et des sapinières subalpines dans l’est du Canada. Thèse de doctorat, Faculté des Sciences et de Génie, Université Laval, Québec, 165 p. PDF 

A4. de Lafontaine, G. & Payette, S. (2009) Fire history of old-growth balsam fir forests in north eastern North America as evidenced from charcoal in mineral soil. The ’88 Fires: Yellowstone and Beyond Conference Proceedings. (ed. by R.E.Masters, K.E.M. Galley & D.G. Despain), pp. 71, Tall Timbers Miscellaneous Publication No. 16, Tall Timbers Research Station, Tallahassee, Florida. PDF 

A3. de Lafontaine, G. & Pelletier, C. (2009) De vieilles forêts sur les sommets du parc national des Monts-Valin. Bulletin de conservation 2009: Les parcs nous ont dévoilé..., Parcs Québec, Québec.pp. 16. PDF 

A2. de Lafontaine, G. (2004) Protocole de suivi des populations d’aster du Saint-Laurent (Symphyotrichum laurentianum), aux Îles-de-la-Madeleine. Rapport scientifique, Ministère de l’environnement du Québec, Québec, 32 p.

A1. de Lafontaine, G. (2004) Richesse spécifique le long d’un gradient de production: utilisation d’une approche multivariée. Mémoire de maîtrise, Faculté des Sciences et de Génie, Université Laval, Québec, 52 p. PDF 


Conférences et symposiums

C22. de Lafontaine, G. (conférencier invité 'keynote speaker') (2015) Biogeographic inferences using local-scale soil macrofossil charcoal analysis. Local to global significance of charcoal science, Antraco2015-6th International Anthracology Meeting. Fribourg, Allemagne, 31 août 2015.

C21. de Lafontaine, G,, Prunier, J., Gérardi, S., Bousquet, J. (2015) Tracking the progression of speciation: variable patterns of introgression across the genome provide insights on the species delimitation between progenitor-derivative spruces (Picea mariana × P. rubens). Journée étudiante de l’IBIS, Québec, Canada, 27 août 2015.

C20. Petit, R.J. (Orateur), de Lafontaine, G., Ouayjan, A., Corcket, E., Ducousso, A., Hampe, A. (2015) Climate refugia as centers of endemism. Ecological science at the frontier, 100th ESA annual meeting, Baltimore, Maryland, 14 août 2015.

C19. de Lafontaine, G., Bousquet, J. (2015) Genomic and geographic analysis of the introgression between progenitor-derivative spruce species (Picea mariana × P. rubens). Forests: the importance to the planet and society, IUFRO Tree Biotechnology Conference 2015, Florence, 10 Juin 2015.

C18. de Lafontaine, G., Bousquet, J. (2015) Biogéographie et génomique de l'introgression entre Picea mariana et P. rubens. 9e Colloque annuel du Centre d’Étude de la Forêt. Rimouski, 1 mai 2015.

C17. Petit, R.J., de Lafontaine, G. (2014) The dynamics of hybridization and speciation in forest trees. IBIS et CEF, Université Laval, Québec, 20 mars 2014.

C16. Ducousso, A. (Orateur), de Lafontaine, G., Lefèvre, S., Amasifuen Guerra, C.A., & Petit, R.J. (2013) Les Hêtres des Landes de Gascogne et de l’Entre-deux-Mers : un patrimoine de grande valeur à sauvegarder. Société Linnéenne de Bordeaux, Bordeaux, 16 septembre 2013.

C15. de Lafontaine, G. (Conférencier invité) & Bousquet, J. (2013) Biogeographic and genomic admixture analysis of the contact zone between a progenitor-derivative spruce species pair (Picea mariana x Picea rubens). Équipe Génétique des populations, INRA-BIOGECO, Bordeaux, 9 septembre 2013.

C14. de Lafontaine, G., Ducousso, A., Amasifuen Guerra, C.A., Lefèvre, S. & Petit R.J. (2013) Hêtre ou ne pas hêtre: une approche intégrée pour reconstituer l'histoire écologique de Fagus sylvatica à sa marge chaude de répartition. 7e Colloque annuel du Centre d’Étude de la Forêt, Montebello, 23 avril 2013.PDF de la présentation 

C13. Ducousso, A. (Orateur), de Lafontaine, G., Lavigne, B., Le Bouler, H., Lefèvre, S.& Petit, R.J. (2013) Future of European beech in Picardy. Conférence finale MULTIFOR: Le rôle multifonctionnel des forêts face au changement climatique, Amiens, 10 avril 2013.PDF de la présentation 

C12. de Lafontaine, G., Amasifuen Guerra, C.A., Lefèvre, S.,Ducousso, A.& Petit, R.J. (Orateur) (2013) Reconstitution de l’histoire du hêtre en Aquitaine à l’aide de données fossiles et génétique. Séminaire scientifique inter LabEx COTE-LaScArBx , Talence, 7 février 2013.

C11. de Lafontaine, G., Ducousso, A., Amasifuen Guerra, C.A., Lefèvre, S. & Petit, R.J. (2012) Integrating palaeocology and genetics to uncover stand-scale glacial beech refugium – Example from the Ciron valley, Southwestern France (Poster). Genetics of Fagaceae  , IUFRO 2012, University Bordeaux 1, Talence, October 9-12, 2012. PDF de l'affiche  Meeting Report 

C10. de Lafontaine, G. (Conférencier invité), Ducousso, A., Amasifuen Guerra, C.A., Lefèvre, S.& Petit R.J. (2012) Uncovering glacial refugia at multliple spatial scales: The case of Fagus sylvatica in France. PAGES workshop: Climate Refugia - Joint Inference from Fossils, Genetics, and Models , University of Oregon, Eugene, Oregon, August 1, 2012. Meeting Report 1  Meeting Report 2 

C9. Lefèvre, S., de Lafontaine, G. (Orateur), Ducousso, A. & Petit R.J.(2011) To beech or not to beech: Genetic history of a widespread European tree species (Fagus sylvatica) at its warm distribution edge. XVIII. INQUA Congress, The International Union for Quaternary Research, Bern, July 23, 2011. PDF 

C8. de Lafontaine. G.,& Payette S. (2011) Shifting zonal patterns of the southern boreal forest in eastern Canada associated with changing fire regime during the Holocene (Poster). XVIII. INQUA Congress, The International Union for Quaternary Research, Bern, July 23, 2011.PDF 

C7. de Lafontaine, G., Lefèvre, S., Dusousso, A. & Petit, R.J. (2011) Hêtre ou ne pas hêtre: Histoire écologique et génétique des hêtres de la vallée du Ciron. Les entretiens du Sauternais , 1ère édition, Bommes, 3 juin 2011.

C6. de Lafontaine, G., Invité. (2011) Écologie, paléoécologie et génétique: une approche intégrée comme outil d’étude de la biogéographie des écosystèmes terrestres. INRA-BIOGECO , Bordeaux, 11 février 2011.

C5. de Lafontaine, G., Invité.(2010)Origine holocène et dynamique récente des pessières d’épinette blanche et des sapinières subalpines dans l’est du Canada. IMEP , Aix-en-Provence, 10 décembre 2010.

C4. de Lafontaine, G., Turgeon, J. & Payette, S. (2010) Phylogeography of white spruce (Picea glauca) in eastern North America reveals contrasting ecological trajectories. 5th annual meeting of the Canadian Society for Ecology and Evolution , Québec, May 10, 2010.

C3. de Lafontaine, G., Turgeon, J. & Payette, S. (2010) Histoire Holocène de l’épinette blanche (Picea glauca) dans l’est de l’Amérique du Nord telle que révélée par la phylogéographie. Partageons nos expériences!, 1er colloque de biologie de l’Université Laval, Québec, 3 février 2010.

C2. de Lafontaine, G. & Payette, S. (2009) Reconstitution de l’histoire holocène des feux dans les vieux peuplements de sapinière par des charbons enfouis dans le sol minéral. La science en français: une affaire capitale!, 77e congrès de l’Association francophone pour le savoir, Ottawa,14 mai 2009.

C1. de Lafontaine, G. & Payette, S. (2008) Fire history of subalpine old-growth white spruce and balsam fir forests in north eastern North America as evidenced by charcoal in mineral soil. The ’88 Fires: Yellowstone and Beyond , International Association of Wildland Fire, Jackson Hole, Wyoming, September 24, 2008.


Subventions, bourses et distinctions

2012 IUFRO – Prix «meilleure affiche» IUFRO 2012 Conference: Genetics of Fagaceae

2011 INRA-EFPA – Subvention de recherche «Projets innovants 2011» (chercheur titulaire)

2010-2012 FQRNT – Bourse de recherche postdoctorale

2009-2011 Centre d’études nordiques – Prix d’excellence en publication (×4)

2008-2009 CRSNG – Bourse d’études supérieures du Canada Alexander-Graham-Bell

2007 CRSNG – Bourse d’études supérieures du CRSNG

2007-2009 FQRNT – Bourse de doctorat en recherche (déclinée)

2005 Inscription du mémoire de maîtrise au tableau d’honneur du doyen de la Faculté des études supérieures

2002 Smithsonian Tropical Research Institute & McGill University – Neo Fellowship (déclinée)


Implications professionnelles

2012- Membre du Centre d’étude de la forêt (CEF) 
2012 Membre du comité de direction: 2nd Steering Board meeting of EcoGenes project, Seville, Spain, 17 avril 2012.
2011 Évaluation d’une demande de subvention CRSNG
2011 Délégué INRA-Biogeco: EcoGenes kick-off meeting, Seville, Spain, January 26-28, 2011.
2011-2012 Représentant des postdocs (élu) au conseil de service de l’unité mixte de recherche Biogeco
2010- Membre: International Biogeography Society (IBS) 
2010- Membre: Société canadienne d'écologie et d'évolution (SCEE) 
2009 Délégué de la Chaire de recherche nordique en écologie des perturbations: ACUNS Conference & NSERC Chairs Meeting, Whitehorse, October 2-5, 2009.
2009- Membre: Association francophone pour le savoir (ACFAS) 
2008-2010 Membre: International Association of Wildland Fire (IAWF) 
2005-2010 Membre: Centre d’études nordiques (CEN) 
2005 Participation à l’élaboration du dépliant publicitaire de l’IQBIO (4 photographies)
2005- Membre: Institut québécois de la biodiversité (IQBIO) 

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14 au 18 août | Orford Musique (à 30 minutes de Sherbrooke)
Aménagement des écosystèmes forestiers (ENV7010) 
14 au 25 août 2017, FERLD, Abitibi
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24-29 septembre 2017, Toscane, Italie

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Jérémie Alluard (2016) Les statistiques au moments de la rédaction 

  • Ce document a pour but de guider les étudiants à intégrer de manière appropriée une analyse statistique dans leur rapport de recherche.

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