Jean Bousquet

Membre régulier
Génécologie, génétique et génomique

Université Laval
Faculté de Foresterie et Géomatique
Chaire de recherche du Canada en génomique forestière
Pavillon Charles-Eugène-Marchand, local 2267
1030 avenue de la Médecine
Québec (Québec) G1V 0A6
Canada

(418) 656-2127

Site départemental  | Autre site 

Personnel
Postdoctorats
Claire Depardieu
Julie Godbout
Guillaume de Lafontaine
Professionnels
Aïda Azaiez
Sylvie Blais
Sébastien Gérardi
Sauphie Senneville

Directions d'étudiants

Doctorats
Justine Laoué
Atef Sahli

Codirections

Maîtrises
Guillaume Otis Prudhomme
Ancien personnel
France Gagnon (Prof. de rech. 2016)
Benjamin Hornoy (Postdoc 2015)
Patrick Lenz (Postdoc 2015)
Trevor Doerksen (Postdoc 2014)
Betty Pelgas (Prof. de rech. 2014)
Astrid Deschênes (Prof. de rech. 2013)
Betty Pelgas (Postdoc 2012)
Marie-Claire Namroud (Postdoc 2011)
Tran Thi Hoa (Postdoc 2010)
Xiaoxin Wei (Postdoc 2010)
Stéphanie Beauseigle (Prof. de rech. 2009)
Catherine Dhont (Postdoc 2008)
Juan Pablo Jaramillo-Correa (Postdoc 2008)
Nathalie Pavy (Postdoc 2008)
Stacey Lee Thomson (Postdoc 2008)
Nathalie Pavy (Prof. de rech. 2008)
Patrick Meirmans (Postdoc 2007)
Betty Pelgas (Prof. de rech. 2007)
Jean-Luc Jany (Postdoc 2006)
Carine Guillet-Claude (Postdoc 2005)

Étudiants diplômés
Dirigés
Juliana Stival Sena (Ph.D. 2017)
Mebarek Lamara (Ph.D. 2017)
Benjamin Cinget (Ph.D. 2015)
Émile Warren (M.Sc. 2015)
Julien Prunier (Ph.D. 2012)
Julie Godbout (Ph.D. 2011)
Patricia Talbot (M.Sc. 2011)
Damien Hinsinger (Ph.D. 2010)
Michée Lemieux (M.Sc. 2010)
Sébastien Gérardi (M.Sc. 2009)
Marie Bouillé (Ph.D. 2007)
Betty Pelgas (Ph.D. 2006)
Stéphanie Beauseigle (M.Sc. 2005)
Codirigés
Guillaume Tessier (M.Sc. 2014)
Jessika Pickford (M.Sc. 2010)
Gabriela Guigou Cairous (M.Sc. 2008)
André Gagné (M.Sc. 2005)
FORMATION
  • Postdoctorat en phylogénie moléculaire des arbres, 1989-1990 (Oregon State University)
  • Ph.D. en génétique forestière, 1986-1989 (Université Laval et Université d'Alberta)
  • Études en génétique forestière, 1984-1986 (Université Laval et Institut forestier national de Petawawa (IFNP))
  • B.Sc. en génie forestier, 1984 (Université Laval)

Titulaire de la Chaire de recherche du Canada en génomique forestière , qui a été récemment renouvelée pour un troisième mandat de 7 ans, de 2015 à 2022, soit une première parmi les chaires de recherche du Canada de niveau senior.

THÈMES DE RECHERCHE

Dans le cadre de la Chaire de recherche du Canada en génomique forestière (niveau 1) renouvelée jusqu’en 2022, nos activités de recherche portent sur l'estimation de la diversité moléculaire et génomique pour les fins de l'analyse phylogénétique, l’évolution, la biogéographie et la génétique des populations chez les essences forestières. Le séquençage et la cartographie des génomes, ainsi que le développement d’outils et de ressources génomiques comme les grands catalogues de gènes et les puces de génotypage font également partie de nos efforts de recherche, de même que l’accélération des activités de sélection de variétés adaptées d’arbres en reboisement par la mise au point de méthodes ayant recours à la génomique prédictive. Ceci devient prioritaire comme mesure d’adaptation aux changements climatiques anticipés, en accélérant le développement de variétés qui seront productives et plus résilientes aux stress abiotiques et biotiques. Ces travaux sont principalement supportés par le CRSNG, Génome Canada, Génome Québec, RNCan, MRIF, FRQ-NT et ils impliquent plusieurs partenaires.

RÉALISATIONS RÉCENTES

Phylogéographie des génomes cytoplasmiques

Nos efforts récents dans ce domaine ont permis d’établir la structure géographique de la variation génétique chez d’autres espèces conifériennes à vaste distribution boréale comme Abies balsamea et Larix laricina, et dans l’ouest chez Abies lasiocarpa et Pinus contorta. Ces études ont permis d’identifier de nouveaux refuges glaciaires génétiquement différenciés et les voies de recolonisation postglaciaire, de déceler des décalages de colonisation à certains endroits comme chez L. laricina dans l’Ouest, entraînant une plus forte structuration géographique de la variation. Les populations d’A. balsamea sont aussi apparues beaucoup plus structurées géographiquement que celles d’autres espèces conifériennes sympatriques, indiquant un plus faible flux génique et la possible implication des épidémies récurrentes de la tordeuse des bourgeons de l’épinette dans ce phénomène. Des zones de contact où l’hybridation naturelle et l’introgression ont pris place sur de relativement grandes distances ont été identifiées dans l’Ouest chez les sapins et les pins durs. La co-localisation géographique de certains refuges avec ceux déjà identifiés chez d’autres espèces boréales à vaste distribution a pu être observée, comme avec Picea mariana, Picea glauca et Pinus banksiana. Via des collaborations à l’international, ces études ont également considéré plusieurs espèces subtropicales montagnardes de sapin et de d’épinette, ainsi que Picea rubens aux États-Unis, où des pertes marquées de diversité génétique ont été observées.

Génomique

Diverses ressources génomiques ont été développées pour P. glauca et P. mariana via de grands projets canadiens de génomique en partenariat (SMarTForests, GenAC, FastTRAC) et via la participation à des initiatives internationales pour Picea abies, incluant la mise au point de grands catalogues de gènes et de leurs polymorphismes, des puces de génotypage, des cartes du génome positionnant les gènes ainsi que le séquençage des génomes d’épinettes. Ces ressources auront permis plusieurs avancées fondamentales dont l’identification du syndrome d’obésité et de paralysie relative des génomes de Pinaceae depuis plus de 100 millions d’années, l’identification de régions du génome et de gènes importants pour l’adaptation au climat et à la résistance aux pathogènes, ainsi que la mise au point de méthodes permettant l’identification des régions du génome plus ou moins perméables au flux génique et à l’introgression dans les zones hybrides, comme entre P. rubens et de P. mariana au Québec. Des systèmes de prédiction par la génomique de la valeur future des arbres au niveau de leurs caractéristiques du bois et de croissance ont aussi été développés et appliqués aux populations d’amélioration avancée de P. glauca et de P. mariana au Québec. Les travaux en cours de génomique prédictive via les grands projets FastTRAC  et Spruce-Up visent particulièrement la résilience des variétés futures aux stress environnementaux.

DISTINCTIONS RÉCENTES
Vous pouvez télécharger toutes mes références bibliographqiues en format BibTeX, BibTeX-CSV ou EndNote.
PUBLICATIONS
Livres


  1. Plomion, C., Bousquet, J. and Kole, C. (2011) Genetics, Genomics and Breeding of Conifers. Edenbridge Science Publishers & CRC Press, New York. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )


Chapitres de livre


  1. Park, Y.S., Beaulieu, J. and Bousquet, J. (2016) Multi-varietal forestry integrating genomic selection and somatic embryogenesis. In Vegetative Propagation of Forest Trees. (Y.-S. Park, J. Bonga & H.K. Moon, Eds.) National Institute of Forest Science, Seoul, South Korea, pages 302-322. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  2. Ritland, K., Krutovsky, K., Tsumura, B., Pelgas, B., Isabel, N. and Bousquet, J. (2011) Genetic mapping in conifers. (Chap. 5) In Genetics, Genomics and Breeding of Conifers. (Plomion, C. and Bousquet, J. and Kole, C., Eds.) Edenbridge Science Publishers & CRC Press, New York, pages 196-238. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  3. Beaulieu, J. and Bousquet, J. (2010) Facteurs génétiques affectant la variabilité des cernes annuels chez les espèces arborescentes nordiques. (Chap. 6) In La dendroécologie: principes, méthodes et applications. (Payette, S. and Filion, L., Eds.) Presses de l'Université Laval, pages 137-163. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  4. Beaulieu, J., Daoust, G., Deshaies, A., Lamhamedi, M., Rainville, A., Tourigny, M., Bousquet, J. and MacKay, J. (2009) Amélioration génétique des arbres, gestion des vergers à graines et de semences, et production de plants forestiers. (Chap. 28) In Manuel de foresterie, 2e édition. (Ordre des Ingénieurs forestiers du Québec, Eds.) Éditions Multimondes, pages 1093-1146. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  5. Bousquet, J., Isabel, N., Pelgas, B., Cottrell, J., Rungis, D. and Ritland, K. (2007) Spruce. (Chap. 3) In Genome Mapping and Molecular Breeding in Plants. (C. Kole, Eds.) Berlin-Heidelberg, Springer-Verlag, pages 93-114. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  6. Pavy, N. and Bousquet, J. (2007) Identifying duplications in genomic data using the CrimeStat Nearest Neighbor Hierarchical Spatial Clustering routine. In CrimeStat: A Spatial Statistics Program for the Analysis of Crime Incident Locations, Ned Levine & Associates, Houston, TX, and the National Institute of Justice, Washington, DC.. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  7. Beaulieu, J. and Bousquet, J. (2006) Optimisation du choix et du rendement des sources améliorées d’épinette blanche en fonction des caractéristiques physiques des sites à reboiser. In Forum de transfert sur l’aménagement et l’environnement forestiers, Fonds québécois de la recherche sur la nature et les technologies et Ministère des Ressources naturelles et de la faune du Québec, pages 175-180. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  8. Beaulieu, J., Brouillette, J.-G., Daoust, G., Mercier, S., Perreault, F.-N., Plourde, A., Rainville, A., Robert Daniel, D., Villeneuve, M., Bousquet, J., Magnussen, S. and Stipanicic, A. (1996) Amélioration des arbres, Production de plants. (Chap. 21) In Manuel de foresterie, Les Presses de l’Université Laval, Québec, pages 913-964. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  9. Isabel, N., Boivin, R., Levasseur, C., Charest, P.-M., Bousquet, J. and Tremblay, F.M. (1995) Evidence of somaclonal variation in somatic embryo-derived plantlets of white spruce (Picea glauca (Moench) Voss.). In Current Issues in Plant Molecular and Cellular Biology. (Terzi, M. and Cella, R. and Falavigna, A., Eds.) Kluwer, Boston, pages 247-252. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  10. Bousquet, J. and Lalonde, M. (1991) The population genetics of alder: an overview. In Biochemical Markers in the Population Genetics of Forest Trees. (Fineshi, S. and Malvoti, E. and Cannata, F. anf Hattemer, H.H., Eds.) SPB Academic Publishing, The Hague, Netherlands, pages 105-112. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  11. Bousquet, J. and Lalonde, M. (1990) The genetics of actinorhizal Betulaceae. In The Biology of Frankia and Actinorhizal Plants. (Schwintzer, C.H. and Tjepkema, J.D., Eds.) Academic Press, New York, pages 239-261. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  12. Lalonde, M., Simon, L., Bousquet, J. and Seguin, A. (1988) Advances in the taxanomy of Frankia: Recognition of species Alni and Elaeagni and novel subspecies Pommerii and Vandijkii. In Nitrogen Fixation: Hundred Years After. (.Bothe, H. and de Bruijn, F.J. and Newton, W.E., Eds.) Gustav Fisher Verlag, New York, pages 671-680. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )


Livres et actes de colloques publiés à titre d'éditeur



Articles publiés dans des revues avec comité de lecture


  1. de Lafontaine, G. and Bousquet, J. (2017) Asymmetry matters: A genomic assessment of directional biases in gene flow between hybridizing spruces. Ecology and Evolution, 7(11):3883-3893. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  2. Lenz, P.R.N., Beaulieu, J., Mansfield, S.D., Clément, S., Desponts, M. and Bousquet, J. (2017) Factors affecting the accuracy of genomic selection for growth and wood quality traits in an advanced-breeding population of black spruce (Picea mariana). BMC Genomics, 18(1):335. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  3. Pavy, N., Lamothe, M., Pelgas, B., Gagnon, F., Birol, I., Bohlmann, J., Mackay, J., Isabel, N. and Bousquet, J. (2017) A high-resolution reference genetic map positioning 8.8 K genes for the conifer white spruce: structural genomics implications and correspondence with physical distance. The Plant Journal, 90(1):189-203. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  4. Pavy, N., Gagnon, F., Deschenes, A., Boyle, B., Beaulieu, J. and Bousquet, J. (2016) Development of highly reliable in silico SNP resource and genotyping assay from exome capture and sequencing: an example from black spruce (Picea mariana). Molecular Ecology Resources, 16(2):588-598. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  5. Jackman, S.D., Warren, R.L., Gibb, E.A., Vandervalk, B.P., Mohamadi, H., Chu, J., Raymond, A., Pleasance, S., Coope, R., Wildung, M.R., Ritland, C.E., Bousquet, J., Jones, S.J.M., Bohlmann, J. and Birol, I. (2016) Organellar genomes of white spruce (Picea glauca): assembly and annotation. Genome Biology and Evolution, 8(1):29-41. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  6. Villeneuve, I., Lamhamedi, M.S., Benomar, L., Rainville, A., de Blois, J., Beaulieu, J., Bousquet, J., Lambert, M.-C. and Margolis, H. (2016) Morpho-physiological variation of white spruce seedlings from various seed sources and implications for deployment under climate change. Frontiers in Plant Science, 7(1450). (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  7. Benomar, L., Lamhamedi, M.S., Rainville, A., Beaulieu, J., Bousquet, J. and Margolis, H.A. (2016) Genetic adaptation versus ecophysiological plasticity of photosynthetic-related traits in young Picea glauca trees along a regional climatic gradient. Frontiers in Plant Science, 7(48). (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  8. Warren, E., de Lafontaine, G., Gerardi, S., Senneville, S., Beaulieu, J., Perron, M., Jaramillo-Correa, J.P. and Bousquet, J. (2016) Joint inferences from cytoplasmic DNA and fossil data provide evidence for glacial vicariance and contrasted post-glacial dynamics in tamarack, a transcontinental conifer. Journal of Biogeography, 43(6):1227-1241. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  9. Lamara, M., Raherison, E., Lenz, P., Beaulieu, J., Bousquet, J. and MacKay, J. (2016) Genetic architecture of wood properties based on association analysis and co-expression networks in white spruce. New Phytologist, 210(1):240-255. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  10. Hornoy, B., Pavy, N., Gérardi, S., Beaulieu, J. and Bousquet, J. (2015) Genetic Adaptation to Climate in White Spruce Involves Small to Moderate Allele Frequency Shifts in Functionally Diverse Genes. Genome Biology and Evolution, 7(12):3269-3285. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  11. Jaramillo-Correa, J.P., Gérardi, S., Beaulieu, J., Ledig, F. T. and Bousquet, J. (2015) Inferring and outlining past population declines with linked microsatellites: a case study in two spruce species. Tree Genetics and Genomes, 11(1):1-12. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  12. Prunier, J., Tessier, G., Bousquet, J. and MacKay, J. (2015) From genotypes to phenotypes: expression levels of genes encompassing adaptive SNPs in black spruce. Plant Cell Reports, 34(12):2111-2125. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  13. De Lafontaine, G., Prunier, J., Gerardi, S. and Bousquet, J. (2015) Tracking the progression of speciation: Variable patterns of introgression across the genome provide insights on the species delimitation between progenitor-derivative spruces ((Picea mariana × P. rubens)). Molecular Ecology, 24(20):5229-5247. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  14. Cinget, B., Gerardi, S., Beaulieu, J. and Bousquet, J. (2015) Less pollen-mediated gene flow for more signatures of glacial lineages: Congruent evidence from balsam Fir cpDNA and mtDNA for multiple refugia in eastern and central North America. PLoS ONE, 10(4):e122815. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  15. Cinget, B., De Lafontaine, G., Gerardi, S. and Bousquet, J. (2015) Integrating phylogeography and paleoecology to investigate the origin and dynamics of hybrid zones: insights from two widespread North American firs. Molecular Ecology, 24(11):2856-2870. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  16. Warren, R.L., Keeling, C.I., Yuen, M.M.S., Raymond, A., Taylor, G.A., Vandervalk, B.P., Mohamadi, H., Paulino, D., Chiu, R., Jackman, S.D., Robertson, G., Yang, C., Boyle, B., Hoffmann, M., Weigel, D., Nelson, D.R., Ritland, C., Isabel, N., Jaquish, B., Yanchuk, A., Bousquet, J., Jones, S.J.M., MacKay, J., Birol, I. and Bohlmann, J. (2015) Improved white spruce (Picea glauca) genome assemblies and annotation of large gene families of conifer terpenoid and phenolic defense metabolism. Plant Journal, 83(2):189-212. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  17. Benomar, L., Lamhamedi, M. S., Villeneuve, I., Rainville, A., Beaulieu, J., Bousquet, J. and Margolis, H.A. (2015) Fine-scale geographic variation in photosynthetic-related traits of Picea glauca seedlings indicates local adaptation to climate. Tree Physiology, 35(8):864-878. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  18. Carles, S., Boyer Groulx, D., Lamhamedi, M.S., Rainville, A., Beaulieu, J., Bernier, P.Y., Bousquet, J., Deblois, J. and Margolis, H.A. (2015) Family Variation in the Morphology and Physiology of White Spruce (Picea glauca) Seedlings in Response to Elevated CO2 and Temperature. Journal of Sustainable Forestry, 34(3):169-198. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  19. Taft, S., Najar, A., Godbout, J., Bousquet, J. and Erbilgin, N. (2015) Variations in foliar monoterpenes across the range of jack pine reveal three widespread chemotypes: Implications to host expansion of invasive mountain pine beetle. Frontiers in Plant Science, 6(MAY):1-12. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  20. Rossi, S. and Bousquet, J. (2014) The bud break process and its variation among local populations of boreal black spruce. Frontiers in Plant Science, 5(574). (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  21. Meirmans, P. G., Gros-Louis, M. C., Lamothe, M., Perron, M., Bousquet, J. and Isabel, N. (2014) Rates of spontaneous hybridization and hybrid recruitment in co-existing exotic and native mature larch populations. Tree Genetics and Genomes, 10(4):965-975. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  22. De La Torre, A.R., Birol, I., Bousquet, J., Ingvarsson, P.K., Jansson, S., Jones, S.J.M., Keeling, C.I., MacKay, J., Nilsson, O., Ritland, K., Street, N., Yanchuk, A., Zerbe, P. and Bohlmann, J. (2014) Insights into conifer giga-genomes. Plant Physiology, 166(4):1724-1732. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  23. Hinsinger, D. D., Gaudeul, M., Couloux, A., Bousquet, J. and Frascaria-Lacoste, N. (2014) The phylogeography of Eurasian Fraxinus species reveals ancient transcontinental reticulation. Molecular Phylogenetics and Evolution, 77:223-237. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  24. Lind, M., Kallman, T., Chen, J., Ma, X.-F., Bousquet, J., Morgante, M., Zaina, G., Karlsson, B., Elfstrand, M., Lascoux, M. and Stenlid, J. (2014) A Picea abies linkage map based on SNP markers identifies QTLS for four aspects of resistance to Heterobasidion parviporum infection. PLoS ONE, 9(7). (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  25. Godbout, J. and Bousquet, J. (2014) Les génomes du pin gris (Pinus banksiana Lamb.) et du pin tordu (Pinus contorta Dougl. Ex. Loud.), témoins des bouleversements climatiques passés. Le Naturaliste canadien, 138:32-44. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  26. Doerksen, T.K., Bousquet, J. and Beaulieu, J. (2014) Inbreeding depression in intra-provenance crosses driven by founder relatedness in white spruce. Tree Genetics and Genomes, 10(1):203-212. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  27. Stival Sena, J., Giguere, I., Boyle, B., Rigault, P., Birol, I., Zuccolo, A., Ritland, K., Ritland, C., Bohlmann, J., Jones, S., Bousquet, J. and MacKay, J. (2014) Evolution of gene structure in the conifer Picea glauca: a comparative analysis of the impact of intron size. BMC Plant Biology, 14(1):95. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  28. Beaulieu, J., Doerksen, T., Clement, S., MacKay, J. and Bousquet, J. (2014) Accuracy of genomic selection models in a large population of open-pollinated families in white spruce. Heredity, 113(4):343-352. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  29. Beaulieu, J., Doerksen, T.K., MacKay, J., Rainville, A. and Bousquet, J. (2014) Genomic selection accuracies within and between environments and small breeding groups in white spruce. BMC Genomics, 15(1). (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  30. Pavy, N., Deschênes, A., Blais, S., Lavigne, P., Beaulieu, J., Isabel, N., MacKay, J. and Bousquet, J. (2013) The Landscape of Nucleotide Polymorphism among 13,500 Genes of the Conifer Picea glauca, Relationships with Functions, and Comparison with Medicago truncatula. Genome Biology and Evolution, 5(10):1910-1925. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  31. Hinsinger, D. D., Basak, J., Gaudeul, M., Cruaud, C., Bertolino, P., Frascaria-Lacoste, N. and Bousquet, J. (2013) The Phylogeny and Biogeographic History of Ashes (Fraxinus, Oleaceae) Highlight the Roles of Migration and Vicariance in the Diversification of Temperate Trees. PLoS ONE, 8(11):e80431. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  32. Jaramillo-Correa, J.P., Aguirre-Planter, E., Eguiarte, L.E., Khasa, D.P. and Bousquet, J. (2013) Evolution of an Ancient Microsatellite Hotspot in the Conifer Mitochondrial Genome and Comparison with Other Plants. Journal of Molecular Evolution, 76(3):146-157. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  33. Nystedt, B., Street, N. R., Wetterbom, A., Zuccolo, A., Lin, Y. C., Scofield, D. G., Vezzi, F., Delhomme, N., Giacomello, S., Alexeyenko, A., Vicedomini, R., Sahlin, K., Sherwood, E., Elfstrand, M., Gramzow, L., Holmberg, K., Hallman, J., Keech, O., Klasson, L., Koriabine, M., Kucukoglu, M., Kaller, M., Luthman, J., Lysholm, F., Niittyla, T., Olson, A., Rilakovic, N., Ritland, C., Rossello, J. A., Sena, J., Svensson, T., Talavera-Lopez, C., Theiszen, G., Tuominen, H., Vanneste, K., Wu, Z. Q., Zhang, B., Zerbe, P., Arvestad, L., Bhalerao, R., Bohlmann, J., Bousquet, J., Garcia G. R., Hvidsten, T. R., de Jong, P., MacKay, J., Morgante, M., Ritland, K., Sundberg, B., Lee Thomson, S., Van de Peer, Y., Andersson, B., Nilsson, O., Ingvarsson, P. K., Lundeberg, J. and Jansson, S. (2013) The Norway spruce genome sequence and conifer genome evolution. Nature, 497:579-584. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  34. Pavy, N., Gagnon, F., Rigault, P., Blais, S., Deschenes, A., Boyle, B., Pelgas, B., Deslauriers, M., Clement, S., Lavigne, P., Lamothe, M., Cooke, J.E., Jaramillo-Correa, J.P., Beaulieu, J., Isabel, N., MacKay, J. and Bousquet, J. (2013) Development of high-density SNP genotyping arrays for white spruce (Picea glauca) and transferability to subtropical and nordic congeners. Molecular Ecology Resources, 13(2):324-336. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  35. Prunier, J., Pelgas, B., Gagnon, F., Desponts, M., Isabel, N., Beaulieu, J. and Bousquet, J. (2013) The genomic architecture and association genetics of adaptive characters using a candidate SNP approach in boreal black spruce. BMC Genomics, 14(1):368. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  36. Birol, I., Raymond, A., Jackman, S.D., Pleasance, S., Coope, R., Taylor, G. A., Yuen, M.M.S, Keeling, C. I., Brand, D., Vandervalk, B. P., Kirk, H., Pandoh, P., Moore, R.A., Zhao, Y., Mungall, A. J., Jaquish, B., Yanchuk, A., Ritland, C., Boyle, B., Bousquet, J., Ritland, K., MacKay, J., Bohlmann, J. and Jones, S.J.M. (2013) Assembling the 20 Gb white spruce (Picea glauca) genome from whole-genome shotgun sequencing data. Bioinformatics, 29(12):1492-1497. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  37. Aguirre-Planter, E., Jaramillo-Correa, J.P., Gomez-Acevedo, S., Khasa, D.P., Bousquet, J. and Eguiarte, L.E. (2012) Phylogeny, diversification rates and species boundaries of Mesoamerican firs (Abies, Pinaceae) in a genus-wide context. Molecular Phylogenetics and Evolution, 62(1):263-274. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  38. Pavy, N., Pelgas, B., Laroche, J., Rigault, P., Isabel, N. and Bousquet, J. (2012) A spruce gene map infers ancient plant genome reshuffling and subsequent slow evolution in the gymnosperm lineage leading to extant conifers. BMC Biology, 10:84. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  39. Talbot, P., Schroeder, W.R., Bousquet, J. and Isabel, N. (2012) When exotic poplars and native Populus balsamifera L. meet on the Canadian Prairies: Spontaneous hybridization and establishment of interspecific hybrids. Forest Ecology and Management, 285:142-152. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  40. Godbout, J., Yeh, F.C. and Bousquet, J. (2012) Large-scale asymmetric introgression of cytoplasmic DNA reveals Holocene range displacement in a North American boreal pine complex. Ecology and Evolution, 2(8):1853-1866. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  41. Prunier, J., Gerardi, S., Laroche, J., Beaulieu, J. and Bousquet, J. (2012) Parallel and lineage-specific molecular adaptation to climate in boreal black spruce. Molecular Ecology, 21(17):4270-4286. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  42. Namroud, M.-C., Bousquet, J., Doerksen, T. and Beaulieu, J. (2012) Scanning SNPs from a large set of expressed genes to assess the impact of artificial selection on the undomesticated genetic diversity of white spruce. Evolutionary Applications, 5(6):641-656. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  43. Arca, M., Hinsinger, D., Cruaud, C., Tillier, A., Bousquet, J. and Frascaria-Lacoste, N. (2012) Deciduous trees and the application of universal DNA Barcodes: A case study on the circumpolar Fraxinus. PLoS ONE, 7(3):e34089. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  44. Pavy, N., Namroud, M.-C., Gagnon, F., Isabel, N. and Bousquet, J. (2012) The heterogeneous levels of linkage disequilibrium in white spruce genes and comparative analysis with other conifers. Heredity, 108(3):273-284. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  45. Chen, J., Kallman, T., Ma, X., Gyllenstrand, N., Zaina, G., Morgante, M., Bousquet, J., Eckert, A., Wegrzyn, J., Neale, D.B., Lagercrantz, U. and Lascoux, M. (2012) Disentangling the Roles of History and Local Selection in Shaping Clinal Variation of Allele Frequencies and Gene Expression in Norway Spruce (Picea abies). Genetics, 191(3):865-881. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  46. Beaulieu, J., Doerksen, T., Boyle, B., Clement, S., Deslauriers, M., Beauseigle, S., Blais, S., Poulin, P.-L., Lenz, P., Caron, S., Rigault, P., Bicho, P., Bousquet, J. and MacKay, J. (2011) Association genetics of wood physical traits in the conifer white spruce and relationships with gene expression. Genetics, 188(1):197-214. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  47. Pelgas, B., Bousquet, J., Meirmans, P., Ritland, K. and Isabel, N. (2011) QTL mapping in white spruce: gene maps and genomic regions underlying adaptive traits across pedigrees, years and environments. BMC Genomics, 12(1):145. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  48. Bouille, M., Senneville, S. and Bousquet, J. (2011) Discordant mtDNA and cpDNA phylogenies indicate geographic speciation and reticulation as driving factors for the diversification of the genus Picea. Tree Genetics and Genomes, 7(3):469-484. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  49. Prunier, J., Laroche, J., Beaulieu, J. and Bousquet, J. (2011) Scanning the genome for gene SNPs related to climate adaptation and estimating selection at the molecular level in boreal black spruce. Molecular Ecology, 20(8):1702-1716. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  50. Beaulieu, J., Raulier, F., Pregent, G. and Bousquet, J. (2011) Predicting site index from climatic, edaphic, and stand structural properties for seven plantationgrown conifer species in Quebec. Canadian Journal of Forest Research, 41(4):682-693. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  51. MacKay, J., Boyle, B., El Kayal, W., Namroud, M.-C., Doerksen, T., Cooke, J., Isabel, N., Beaulieu, J., Rigault, P., Bicho, P. and Bousquet, J. (2011) Gene mapping in white spruce (P. glauca): QTL and association studies integrating population and expression data. BMC Proceedings, 5(Suppl 7):I6. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  52. Rigault, P., Boyle, B., Lepage, P., Cooke, J.E.K., Bousquet, J. and MacKay, J. (2011) A White Spruce Gene Catalog for Conifer Genome Analyses. Plant Physiology, 157(1):14-28. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  53. Lemieux, M.J., Beaulieu, J. and Bousquet, J. (2011) Chloroplast DNA polymorphisms in eastern hemlock: Range-wide genogeographic analyses and implications for gene conservation. Canadian Journal of Forest Research, 41(5):1047-1059. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  54. Wei, X.-X., Beaulieu, J., Khasa, D.P., Vargas-Hernandez, J., Lopez-Upton, J., Jaquish, B. and Bousquet, J. (2011) Range-wide chloroplast and mitochondrial DNA imprints reveal multiple lineages and complex biogeographic history for Douglas-fir. Tree Genetics and Genomes, 7(5):1025-1040. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  55. Namroud, M.-C., Guillet-Claude, C., MacKay, J., Isabel, N. and Bousquet, J. (2010) Molecular Evolution of Regulatory Genes in Spruces from Different Species and Continents: Heterogeneous Patterns of Linkage Disequilibrium and Selection but Correlated Recent Demographic Changes. Journal of Molecular Evolution, 70(4):371-386. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  56. Clement, S., Fillon, J., Bousquet, J. and Beaulieu, J. (2010) TreeSNPs: a laboratory information management system (LIMS) dedicated to SNP discovery in trees. Tree Genetics and Genomes, 6(3):435-438. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  57. Meirmans, P.G., Lamothe, M., Gros-Louis, M.C., Khasa, D.P., Perinet, P., Bousquet, J. and Isabel, N. (2010) Complex patterns of hybridization between exotic and native North American poplar species. American Journal of Botany, 97(10):1688-1697. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  58. Gerardi, S., Jaramillo-Correa, J.P., Beaulieu, J. and Bousquet, J. (2010) From glacial refugia to modern populations: new assemblages of organelle genomes generated by differential cytoplasmic gene flow in transcontinental black spruce. Molecular Ecology, 19(23):5265-5280. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  59. Godbout, J., Beaulieu, J. and Bousquet, J. (2010) Phylogeographic structure of jack pine (Pinus banksiana; Pinaceae) supports the existence of a coastal glacial refugium in northeastern North America. American Journal of Botany, 97(11):1903-1912. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  60. Meirmans, P.G., Bousquet, J. and Isabel, N. (2009) A metapopulation model for the introgression from genetically modified plants into their wild relatives. Evolutionary Applications, 2:160-171. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  61. Jaramillo-Correa, J.P., Beaulieu, J., Khasa, D.P. and Bousquet, J. (2009) Inferring the past from the present phylogeographic structure of North American forest trees: seeing the forest for the genes. Canadian Journal of Forest Research, 39(2):286-307. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  62. Namroud, M-C., Beaulieu, J., Juge, N., Laroche, J. and Bousquet, J. (2008) Scanning the genome for gene single nucleotide polymorphisms involved in adaptive population differentiation in white spruce. Molecular Ecology, 17(16):3599-3613. (PDF  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  63. Godbout, J., Fazekas, A., Newton, C.H., Yeh, F.C. and Bousquet, J. (2008) Glacial vicariance in the Pacific Northwest: evidence from a lodgepole pine mitochondrial DNA minisatellite for multiple genetically distinct and widely separated refugia. Molecular Ecology, 17(10):2463-2475. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  64. Jaramillo-Correa, J.P., Aguirre-Planter, E., Khasa, D.P., Eguiarte, L.E., Pinero, D., Furnier, G.R. and Bousquet, J. (2008) Ancestry and divergence of subtropical montane forest isolates: molecular biogeography of the genus Abies (Pinaceae) in southern Mexico and Guatemala. Molecular Ecology, 17(10):2476-2490. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  65. Pavy, N., Pelgas, B., Beauseigle, S., Blais, S., Gagnon, F., Gosselin, I., Lamothe, M., Isabel, N. and Bousquet, J. (2008) Enhancing genetic mapping of complex genomes through the design of highly-multiplexed SNP arrays: application to the large and unsequenced genomes of white spruce and black spruce. BMC Genomics, 9(21):9-21. (PDF  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  66. Yu, Q., Zhang, S.Y., Pliura, A., MacKay, J., Bousquet, J. and Perinet, P. (2008) Variation in mechanical properties of selected young poplar hybrid crosses. Forest Science, 54(3):255-259. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  67. Pliura, A., Zhang, S.Y., MacKay, J. and Bousquet, J. (2007) Genotypic variation in wood density and growth traits of poplar hybrids at four clonal trials. Forest Ecology and Management, 238(1-3):92-106. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  68. Naydenov, K., Senneville, S., Beaulieu, J., Tremblay, M.F. and Bousquet, J. (2007) Glacial vicariance in Eurasia: mitochondrial DNA evidence from Scots pine for a complex heritage involving genetically distinct refugia at mid-northern latitudes and in Asia Minor. BMC Evolutionary Biology, 7(233). (PDF  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  69. Jany, J.L., Bousquet, J., Gagne, A. and Khasa, D.P. (2006) Simple sequence repeat (SSR) markers in the ectomycorrhizal fungus Laccaria bicolor for environmental monitoring of introduced strains and molecular ecology applications. Mycological Research, 110:51-59. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  70. Gagne, A., Jany, J.L., Bousquet, J. and Khasa, D.P. (2006) Ectomycorrhizal fungal communities of nursery-inoculated seedlings outplanted on clear-cut sites in northern Alberta. Canadian Journal of Forest Research, 36(7):1684-1694. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  71. Jaramillo-Correa, J.P., Beaulieu, J., Ledig, F.T. and Bousquet, J. (2006) Decoupled mitochondrial and chloroplast DNA population structure reveals Holocene collapse and population isolation in a threatened Mexican-endemic conifer. Molecular Ecology, 15(10):2787-2800. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  72. Pliura, A., Zhang, S.Y., Bousquet, J. and MacKay, J. (2006) Age trends in genotypic variation of wood density and its intra-ring components in young poplar hybrid crosses. Annals of Forest Science, 63(7):673-685. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  73. Pelgas, B., Beauseigle, S., Achere, V., Jeandroz, S., Bousquet, J. and Isabel, N. (2006) Comparative genome mapping among Picea glauca, P-mariana x P-rubens and P-abies, and correspondence with other Pinaceae. Theoretical and Applied Genetics, 113(8):1371-1393. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  74. Ouinsavi, C., Sokpon, N., Bousquet, J., Newton, C.H. and Khasa, D.P. (2006) Novel microsatellite DNA markers for the threatened African endemic tree species, Milicia excelsa (Moraceae), and cross-species amplification in Milicia regia. Molecular Ecology Notes, 6(2):480-483. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  75. Pavy, N., Parsons, L.S., Paule, C., MacKay, J. and Bousquet, J. (2006) Automated SNP detection from a large collection of white spruce expressed sequences: contributing factors and approaches for the categorization of SNPs. BMC Genomics, 7:174. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  76. Khasa, D.P., Jaramillo-Correa, J.P., Jaquish, B. and Bousquet, J. (2006) Contrasting microsatellite variation between subalpine and western larch, two closely related species with different distribution patterns. Molecular Ecology, 15(13):3907-3918. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  77. Pavy, N., Laroche, J., Bousquet, J. and MacKay, J. (2005) Large-scale statistical analysis of secondary xylem ESTs in pine. Plant Molecular Biology, 57(2):203-224. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  78. Khasa, D.P., Pollefeys, P., Navarro-Quezada, A., Perinet, P. and Bousquet, J. (2005) Species-specific microsatellite markers to monitor gene flow between exotic poplars and their natural relatives in eastern North America. Molecular Ecology Notes, 5(4):920-923. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  79. Jaramillo-Correa, J.P. and Bousquet, J. (2005) Mitochondrial genome recombination in the zone of contact between two hybridizing conifers. Genetics, 171(4):1951-1962. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  80. Andalo, C., Beaulieu, J. and Bousquet, J. (2005) The impact of climate change on growth of local white spruce populations in Quebec, Canada. Forest Ecology and Management, 205(1-3):169-182. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  81. Pliura, A., Yu, Q.B., Zhang, S.Y., MacKay, J., Perinet, P. and Bousquet, J. (2005) Variation in wood density and shrinkage and their relationship to growth of selected young poplar hybrid crosses. Forest Science, 51(5):472-482. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  82. Gros-Louis, M.-C., Bousquet, J., Paques, L.E. and Isabel, N. (2005) Species-diagnostic markers in Larix spp. based on RAPDs and nuclear, cpDNA, and mtDNA gene sequences, and their phylogenetic implications. Tree Genetics and Genomes, V1(2):50-63. (URL  | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  83. Godbout, J., Jaramillo-Correa, J.P., Beaulieu, J. and Bousquet, J. (2005) A mitochondrial DNA minisatellite reveals the postglacial history of jack pine (Pinus banksiana), a broad-range North American conifer. Molecular Ecology, 14(11):3497-3512. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  84. Pelgas, B., Bousquet, J., Beauseigle, S. and Isabel, N. (2005) A composite linkage map from two crosses for the species complex Picea mariana x Picea rubens and analysis of synteny with other Pinaceae. Theoretical and Applied Genetics, 111(8):1466-1488. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  85. Bouille, M. and Bousquet, J. (2005) Trans-species shared polymorphisms at orthologous nuclear gene loci among distant species in the conifer Picea (Pinaceae): Implications for the long-term maintenance of genetic diversity in trees. American Journal of Botany, 92(1):63-73. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  86. Pavy, N., Paule, C., Parsons, L., Crow, J.A., Morency, M.J., Cooke, J., Johnson, J.E., Noumen, E., Guillet-Claude, C., Butterfield, Y., Barber, S., Yang, G., Liu, J., Stott, J., Kirkpatrick, R., Siddiqui, A., Holt, R., Marra, M., Seguin, A., Retzel, E., Bousquet, J. and MacKay, J. (2005) Generation, annotation, analysis and database integration of 16,500 white spruce EST clusters. BMC Genomics, 6:144. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  87. Koubaa, A., Isabel, N., Zhang, S.Y., Beaulieu, J. and Bousquet, J. (2005) Transition from juvenile to mature wood in black spruce (Picea mariana (Mill.) BSP). Wood and Fiber Science, 37(3):445-455. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  88. Jaramillo-Correa, J.P., Beaulieu, J. and Bousquet, J. (2004) Variation in mitochondrial DNA reveals multiple distant glacial refugia in black spruce (Picea mariana), a transcontinental North American conifer. Molecular Ecology, 13(9):2735-2747. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  89. Guillet-Claude, C., Isabel, N., Pelgas, B. and Bousquet, J. (2004) The evolutionary implications of knox-I gene duplications in conifers: Correlated evidence from phylogeny, gene mapping, and analysis of functional divergence. Molecular Biology and Evolution, 21(12):2232-2245. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  90. Pelgas, B., Isabel, N. and Bousquet, J. (2004) Efficient screening for expressed sequence tag polymorphisms (ESTPs) by DNA pool sequencing and denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) in spruces. Molecular Breeding, 13(3):263-279. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  91. Beaulieu, J., Perron, M. and Bousquet, J. (2004) Multivariate patterns of adaptive genetic variation and seed source transfer in Picea mariana. Canadian Journal of Forest Research, 34(3):531-545. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  92. Gamache, I., Jaramillo-Correa, J.P., Payette, S. and Bousquet, J. (2003) Diverging patterns of mitochondrial and nuclear DNA diversity in subarctic black spruce: imprint of a founder effect associated with postglacial colonization. Molecular Ecology, 12(4):891-901. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  93. Jaramillo-Correa, J.P., Bousquet, J., Beaulieu, J., Isabel, N., Perron, M. and Bouille, M. (2003) Cross-species amplification of mitochondrial DNA sequence-tagged-site markers in conifers: the nature of polymorphism and variation within and among species in Picea. Theoretical and Applied Genetics, 106(8):1353-1367. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  94. Jaramillo-Correa, J.P. and Bousquet, J. (2003) New evidence from mitochondrial DNA of a progenitor-derivative species relationship between black spruce and red spruce(Pinaceae). American Journal of Botany, 90(12):1801-1806. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  95. Pollefeys, P. and Bousquet, J. (2003) Molecular genetic diversity of the French-American grapevine hybrids cultivated in North America. Genome, 46(6):1037-1048. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  96. Khasa, D.P., Nadeem, S., Thomas, B., Robertson, A. and Bousquet, J. (2003) Application of SSR markers for parentage analysis of Populus clones. Forest Genetics, 10:273-281. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  97. Navarro, E., Bousquet, J., Moiroud, A., Munive, A., Piou, D. and Normand, P. (2003) Molecular phylogeny of Alnus (Betulaceae), inferred from nuclear ribosomal DNA ITS sequences. Plant and Soil, 254(1):207-217. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  98. Jany, J.L., Bousquet, J. and Khasa, D.P. (2003) Microsatellite markers for Hebeloma species developed from expressed sequence tags in the ectomycorrhizal fungus Hebeloma cylindrosporum. Molecular Ecology Notes, 3(4):659-661. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  99. Perron, M. and Bousquet, J. (2002) Nouveau regard sur la relation botanique entre l’épinette noire et l’épinette rouge. Le Naturaliste canadien, 126:45-52. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  100. Fournier, D., Perry, D.J., Beaulieu, J., Bousquet, J. and Isabel, N. (2002) Optimizing expressed sequence tag polymorphisms by single strand conformation polymorphism in spruces. Forest Genetics, 9:11–17. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  101. Gosselin, I., Zhou, Y., Bousquet, J. and Isabel, N. (2002) Megagametophyte-derived linkage maps of white spruce (Picea glauca) based on RAPD, SCAR and ESTP markers. Theoretical and Applied Genetics, 104(6-7):987-997. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  102. Perry, D.J. and Bousquet, J. (2001) Genetic diversity and mating system of post-fire and post-harvest black spruce: an investigation using codominant sequence-tagged-site (STS) markers. Canadian Journal of Forest Research, 31(1):32-40. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  103. Beaulieu, J., Rainville, A., Daoust, G. and Bousquet, J. (2001) La diversité génétique des espèces arborescentes de la forêt boréale. Le Naturaliste canadien, 125:193-202. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  104. Senneville, S., Beaulieu, J., Daoust, G., Deslavriers, M. and Bousquet, J. (2001) Evidence for low genetic diversity and metapopulation structure in Canada yew (Taxus canadensis): considerations for conservation. Canadian Journal of Forest Research, 31:110–116. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  105. Jaramillo-Correa, J.P., Beaulieu, J. and Bousquet, J. (2001) Contrasting evolutionary forces driving population structure at expressed sequence tag polymorphisms, allozymes and quantitative traits in white spruce. Molecular Ecology, 10(11):2729-2740. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  106. Khasa, D.P. and Bousquet, J. (2001) Multivariate analysis of allozyme and morphometric variability in Racosperma auriculiforme and R-mangium. Silvae Genetica, 50(5-6):191-199. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  107. Perron, M., Perry, D.J., Andalo, C. and Bousquet, J. (2000) Evidence from sequence-tagged-site markers of a recent progenitor-derivative species pair in conifers. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 97(21):11331-11336. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  108. Morin, R., Beaulieu, J., Deslauriers, M., Daoust, G. and Bousquet, J. (2000) Low genetic diversity at allozyme loci in Juglans cinerea. Canadian Journal of Botany, 78(9):1238-1243. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  109. Koubaa, A., Zhang, S.Y., Isabel, N., Beaulieu, J. and Bousquet, J. (2000) Phenotypic correlations between juvenile-mature wood density and growth in black spruce. Wood and Fiber Science, 32(1):61-71. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  110. Laberge, M.J., Payette, S. and Bousquet, J. (2000) Life span and biomass allocation of stunted black spruce clones in the subarctic environment. Journal of Ecology, 88(4):584-593. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  111. Isabel, N., Beaulieu, J., Theriault, P. and Bousquet, J. (1999) Direct evidence for biased gene diversity estimates from dominant random amplified polymorphic DNA (RAPD) fingerprints. Molecular Ecology, 8(3):477-483. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  112. Perry, D.J., Isabel, N. and Bousquet, J. (1999) Sequence-tagged-site (STS) markers of arbitrary genes: the amount and nature of variation revealed in Norway spruce. Heredity, 83:239-248. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  113. Laroche, J. and Bousquet, J. (1999) Evolution of the mitochondrial rps3 intron in perennial and annual angiosperms and homology to nad5 intron 1. Molecular Biology and Evolution, 16(4):441-452. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  114. Larochelle, F., Forget, E., Rainville, A. and Bousquet, J. (1998) Sources of temporal variation in sap sugar content in a mature sugar maple (Acer saccharum) plantation. Forest Ecology and Management, 106(2-3):307-313. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  115. Perry, D.J. and Bousquet, J. (1998) Sequence-tagged-site (STS) markers of arbitrary genes: the utility of black spruce-derived STS primers in other conifers. Theoretical and Applied Genetics, 97(5-6):735-743. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  116. Perry, D.J. and Bousquet, J. (1998) Sequence-tagged-site (STS) markers of arbitrary genes: Development, characterization and analysis of linkage in black spruce. Genetics, 149(2):1089-1098. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  117. Laroche, J., Li, P., Maggia, L. and Bousquet, J. (1997) Molecular evolution of angiosperm mitochondrial introns and exons. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 94(11):5722-5727. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  118. Li, P., Beaulieu, J. and Bousquet, J. (1997) Genetic structure and patterns of genetic variation among populations in eastern white spruce (Picea glauca). Canadian Journal of Forest Research, 27(2):189-198. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  119. Perron, M. and Bousquet, J. (1997) Natural hybridization between black spruce and red spruce. Molecular Ecology, 6(8):725-734. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  120. Jeandroz, S., Roy, A. and Bousquet, J. (1997) Phylogeny and phylogeography of the circumpolar genus Fraxinus (Oleaceae) based on internal transcribed spacer sequences of nuclear ribosomal DNA. Molecular Phylogenetics and Evolution, 7(2):241-251. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  121. Dewar, K., Bousquet, J., Dufour, J. and Bernier, L. (1997) A meiotically reproducible chromosome length polymorphism in the ascomycete fungus Ophiostoma ulmi (sensu lato). Molecular and General Genetics, 255(1):38-44. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  122. Shooner, F., Bousquet, J. and Tyagi, R.D. (1996) Isolation, phenotypic characterization, and phylogenetic position of a novel, facultatively autotrophic, moderately thermophilic bacterium, Thiobacillus thermosulfatus sp nov. International Journal of Systematic Bacteriology, 46(2):409-415. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  123. Jeandroz, S., Frascaria-Lacoste, N. and Bousquet, J. (1996) Molecular recognition of the closely related Fraxinus excelsior and F. oxyphylla (Oleaceae) by RAPD markers. Forest Genetics, 3:237-242. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  124. Isabel, N., Boivin, R., Levasseur, C., Charest, P.M., Bousquet, J. and Tremblay, F.M. (1996) Occurrence of somaclonal variation among somatic embryo-derived white spruces (Picea glauca, Pinaceae). American Journal of Botany, 83(9):1121-1130. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  125. Dufresne, S., Bousquet, J., Boissinot, M. and Guay, R. (1996) Sulfobacillus disulfidooxidans sp nov, a new acidophilic, disulfide-oxidizing, gram-positive, spore-forming bacterium. International Journal of Systematic Bacteriology, 46(4):1056-1064. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  126. Roy, A. and Bousquet, J. (1996) The evolution of the actinorhizal symbiosis through phylogenetic analysis of host plants. Acta Botanica Gallica, 143(7):635-650. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  127. Boivin, R., Richard, M., Beauseigle, D., Bousquet, J. and Bellemare, G. (1996) Phylogenetic inferences from chloroplast chlB gene sequences of Nephrolepis exaltata (Filicopsida), Ephedra altissima (Gnetopsida), and diverse land plants. Molecular Phylogenetics and Evolution, 6(1):19-29. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  128. Isabel, N., Beaulieu, J. and Bousquet, J. (1995) Complete Congruence between Gene Diversity Estimates Derived from Genotypic Data at Enzyme and Random Amplified Polymorphic DNA Loci in Black Spruce. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 92(14):6369-6373. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  129. Perron, M., Gordon, A.G. and Bousquet, J. (1995) Species-Specific Rapd Fingerprints for the Closely-Related Picea-Mariana and P-Rubens. Theoretical and Applied Genetics, 91(1):142-149. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  130. Khasa, D.P. and Bousquet, J. (1995) Re-wooding bordeline land in Zaire with Racosperma spp. through an integrated genetic improvement programme. Science et Changements Planétaires / Sécheresse, 6:281-288. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  131. Khasa, D.P., Vallee, G., Li, P., Magnussen, S., Camire, C. and Bousquet, J. (1995) Performance of five tropical tree species on four sites in Zaire. Commonwealth Forestry Review, 74:129-137. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  132. Khasa, D.P., Vallee, G. and Bousquet, J. (1995) Provenance Variation in Rooting Ability of Juvenile Stem Cuttings from Racosperma Auriculiforme and R-Mangium. Forest Science, 41(2):305-320. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  133. Khasa, D.P., Li, P., Vallee, G., Magnussen, S. and Bousquet, J. (1995) Early Evaluation of Racosperma-Auriculiforme and Racosperma-Mangium Provenance Trials on 4 Sites in Zaire. Forest Ecology and Management, 78(1-3):99-113. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  134. Jeandroz, G., Faivrerampant, F., Pugin, A., Bousquet, J. and Berville, A. (1995) Organization of Nuclear Ribosomal DNA and Species-Specific Polymorphism in Closely-Related Fraxinus-Excelsior and F-Oxyphylla. Theoretical and Applied Genetics, 91(6-7):885-892. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  135. Laroche, J., Li, P. and Bousquet, J. (1995) Mitochondrial-DNA and Monocot-Dicot Divergence Time. Molecular Biology and Evolution, 12(6):1151-1156. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  136. Savard, L., Li, P., Strauss, S.H., Chase, M.W., Michaud, M. and Bousquet, J. (1994) Chloroplast and Nuclear Gene-Sequences Indicate Late Pennsylvanian Time for the Last Common Ancestor of Extant Seed Plants. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 91(11):5163-5167. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  137. Khasa, D.P., Vallee, G. and Bousquet, J. (1994) Biological considerations in the utilization of Racosperma auriculiforme and R. mangium in tropical countries with emphasis on Zaire. Journal of Tropical Forest Science, 6:422-443. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  138. Khasa, D.P., Cheliak, W.M. and Bousquet, J. (1994) Genetic-Variation in 26 Populations of Racosperma-Auriculiforme and Racosperma-Mangium Using Allozymes. Canadian Journal of Forest Research, 24(6):1123-1132. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  139. Maggia, L. and Bousquet, J. (1994) Molecular Phylogeny of the Actinorhizal Hamamelidae and Relationships with Host Promiscuity Towards Frankia. Molecular Ecology, 3(5):459-467. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  140. Savard, L., Michaud, M. and Bousquet, J. (1993) Genetic diversity and phylogenetic relationships between birches and alders using ITS, 18S rRNA and rbcL gene sequences. Molecular Phylogenetics and Evolution, 2(2):112-8. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  141. Li, P., Beaulieu, J., Corriveau, A. and Bousquet, J. (1993) Genetic-Variation in Juvenile Growth and Phenology in a White Spruce Provenance Progeny Test. Silvae Genetica, 42(1):52-60. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  142. Isabel, N., Tremblay, L., Michaud, M., Tremblay, F.M. and Bousquet, J. (1993) Rapds as an Aid to Evaluate the Genetic Integrity of Somatic Embryogenesis-Derived Populations of Picea-Mariana (Mill) Bsp. Theoretical and Applied Genetics, 86(1):81-87. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  143. Khasa, D.P., Cheliak, W.M. and Bousquet, J. (1993) Mating System of Racosperma-Auriculiforme in a Seed Production Area in Zaire. Canadian Journal of Botany, 71(6):779-785. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  144. Khasa, D.P., Cheliak, W.M. and Bousquet, J. (1993) Effects of Buffer System Ph and Tissue Storage on Starch-Gel Electrophoresis of Allozymes in 3 Tropical Tree Species. Annales des Sciences Forestieres, 50(1):37-56. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  145. Simon, L., Bousquet, J., Levesque, R.C. and Lalonde, M. (1993) Origin and Diversification of Endomycorrhizal Fungi and Coincidence with Vascular Land Plants. Nature, 363(6424):67-69. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  146. Frascaria, N., Maggia, L., Michaud, M. and Bousquet, J. (1993) The Rbcl Gene Sequence from Chestnut Indicates a Slow Rate of Evolution in the Fagaceae. Genome, 36(4):668-671. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  147. Strauss, S.H., Bousquet, J., Hipkins, V.D. and Hong, Y.P. (1992) Biochemical and molecular genetic markers in biosystematic studies of forest trees. New Forests, 6(1):125-158. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  148. Li, P., MacKay, J. and Bousquet, J. (1992) Genetic Diversity in Canadian Hardwoods - Implications for Conservation. Forestry Chronicle, 68(6):709-719. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  149. Roy, A., Frascaria, N., MacKay, J. and Bousquet, J. (1992) Segregating Random Amplified Polymorphic Dnas (Rapds) in Betula-Alleghaniensis. Theoretical and Applied Genetics, 85(2-3):173-180. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  150. Li, P., Parrot, L. and Bousquet, J. (1992) Introduction of Black-Walnut in Southern Quebec - Evaluation of 21-Year-Old Full-Sib Families. Canadian Journal of Forest Research, 22(8):1201-1204. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  151. Bousquet, J., Strauss, S.H. and Li, P. (1992) Complete Congruence between Morphological and Rbcl-Based Molecular Phylogenies in Birches and Related Species (Betulaceae). Molecular Biology and Evolution, 9(6):1076-1088. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  152. Bousquet, J., Strauss, S.H., Doerksen, A.H. and Price, R.A. (1992) Extensive Variation in Evolutionary Rate of Rbcl Gene-Sequences among Seed Plants. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 89(16):7844-7848. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  153. Li, P. and Bousquet, J. (1992) Relative-Rate Test for Nucleotide Substitutions between 2 Lineages. Molecular Biology and Evolution, 9(6):1185-1189. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  154. Dupont, A., Belanger, L. and Bousquet, J. (1991) Relationships between balsam-fir vulnerability to spruce budworm and ecological site conditions of fir stands in central Québec. Canadian Journal of Forest Research, 21(12):1752-1759. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  155. Bousquet, J., Cheliak, W.M., Wang, J. and Lalonde, M. (1990) Genetic-Divergence and Introgressive Hybridization between Alnus-Sinuata and a-Crispa (Betulaceae). Plant Systematics and Evolution, 170(1-2):107-124. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  156. Bousquet, J., Simon, L. and Lalonde, M. (1990) DNA Amplification from Vegetative and Sexual Tissues of Trees Using Polymerase Chain-Reaction. Canadian Journal of Forest Research, 20(2):254-257. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  157. Normand, P. and Bousquet, J. (1989) Phylogeny of Nitrogenase Sequences in Frankia and Other Nitrogen-Fixing Microorganisms. Journal of Molecular Evolution, 29(5):436-447. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  158. Bousquet, J., Girouard, E., Strobeck, C., Dancik, B.P. and Lalonde, M. (1989) Restriction Fragment Polymorphisms in the Rdna Region among 7 Species of Alnus and Betula-Papyrifera. Plant and Soil, 118(1-2):231-240. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  159. Simon, L., Jabajihare, S., Bousquet, J. and Lalonde, M. (1989) Confirmation of Frankia Species Using Cellular Fatty-Acids Analysis. Systematic and Applied Microbiology, 11(3):229-235. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  160. Bousquet, J., Cheliak, W.M. and Lalonde, M. (1988) Allozyme Variation within and among Mature Populations of Speckled Alder (Alnus-Rugosa) and Relationships with Green Alder (Alnus-Crispa). American Journal of Botany, 75(11):1678-1686. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  161. Simon, L., Bousquet, J., Gardes, M., Saint-Laurent, L. and Lalonde, M. (1988) Competitiveness of Frankia Strains on Elaeagnus Clonal Plantlets. FEMS Microbiology Letters, 51(1):13-17. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  162. Saint-Laurent, L., Bousquet, J., Simon, L. and Lalonde, M. (1987) Separation of Various Frankia Strains in the Alnus and Elaeagnus Host Specificity Groups Using Sugar Analysis. Canadian Journal of Microbiology, 33(9):764-772. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  163. Bousquet, J., Cheliak, W.M. and Lalonde, M. (1987) Allozyme Variability in Natural-Populations of Green Alder (Alnus-Crispa) in Quebec. Genome, 29(2):345-352. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  164. Bousquet, J., Cheliak, W.M. and Lalonde, M. (1987) Genetic Differentiation among 22 Mature Populations of Green Alder (Alnus-Crispa) in Central Quebec. Canadian Journal of Forest Research, 17(3):219-227. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  165. Bousquet, J., Cheliak, W.M. and Lalonde, M. (1987) Genetic Diversity within and among 11 Juvenile Populations of Green Alder (Alnus-Crispa) in Canada. Physiologia Plantarum, 70(2):311-318. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  166. Gardes, M., Bousquet, J. and Lalonde, M. (1987) Isozyme Variation among 40 Frankia Strains. Applied and Environmental Microbiology, 53(7):1596-1603. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )


Articles publiés dans des actes de colloque (proceedings)


  1. Bousquet, J., MacKay, J., Khasa, D.P. and Beaulieu, J. (2016) Forestry genomics and genetics research at Université Laval. In Proceedings of the 34th Meeting of the Canadian Forest Genetics Association, Univ. of New Brunswick, Fredericton, August 17-20 2015. (Simpson. D., Eds.) Canadian Forest Service, Fredericton, pages 35-44. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  2. Beaulieu, J. and Bousquet, J. (2016) Genomic selection – Potential and current limits of application in boreal conifer breeding programs. In Proceedings of the 34th Meeting of the Canadian Forest Genetics Association, Univ. of New Brunswick, Fredericton, August 17-20 2015. (Simpson. D., Eds.) Canadian Forest Service, Fredericton, pages 35-44. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  3. Bousquet, J., Khasa, D.P. and MacKay, J. (2014) Progress in functional, ecological and evolutionary forestry genomics research at Université Laval. In Proceedings of the 34th Meeting of the Canadian Forest Genetics Association, Whistler, British Columbia, July 22-25 2013. (Simpson. D., Eds.) Canadian Forest Service, Fredericton, pages 35-44. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  4. Bousquet, J., Khasa, D.P. and MacKay, J. (2012) Functional, ecological and evolutionary genomics. In Proc. 32nd Meeting of the Canadian Forest Genetics Association. Thunder Bay, Ontario, August. (Simpson, D., Eds.) Canadian Forest Service, Fredericton, New Brunswick, pages 30-40. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  5. Boyer-Groulx, D., Carles, S., Lamhamedi, M.S., Beaulieu, J., Stowe, D.C., Margolis, H.A., Rainville, A., Bernier, P.Y. and Bousquet, J. (2011) Réponses morpho-physiologiques des familles d’épinette blanche aux changements climatiques. In Comptes-rendus du Colloque « Production de plants forestiers au Québec: la culture de l’innovation ». Pages 107-112. Carrefour Forêt Innovations. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  6. MacKay, J., Boyle, B., Rigault, P., Bousquet, J., Beaulieu, J., Isabel, N., Seguin, A. and Perron, M. (2011) Le développement d’outils moléculaires pour accélérer les programmes d’amélioration génétique des arbres au Québec. In Comptes-rendus du Colloque « Production de plants forestiers au Québec: la culture de l’innovation ». Pages 125-130. Carrefour Forêt Innovations. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  7. Bousquet, J., Khasa, D.P. and MacKay, J. (2009) Functional and diversity genomics at Laval University. In Proc. 31st Meeting of the Canadian Tree Improvement/Forest Genetics Association. (Simpson, D., Eds.) Pages 43-48. Canadian Forest Service, Fredericton. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  8. MacKay, J., Bousquet, J., Ritland, K. and Bohlmann, J. (2009) An international consortium in conifer genomics. Why, how, who and what? In Proceedings of the 30th Southern Tree Improvement Conference. Page 27. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  9. Bousquet, J., Khasa, D.P. and MacKay, J. (2007) Recent advances in forest and tree genomics at Laval. In 30th Meeting of the Canadian Tree Improvement Association. Part I. (D. Simpson, Eds.) Canadian Forest Service, Fredericton, pages 35-40. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  10. Beaulieu, J. and Bousquet, J. (2006) Optimisation du choix et du rendement des sources améliorées d’épinette blanche en fonction des caractéristiques physiques des sites à reboiser. In Forum de transfert sur l’aménagement et l’environnement forestiers. Pages 175-180. Fonds québécois de la recherche sur la nature et les technologies et Ministère des Ressources naturelles et de la faune du Québec. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  11. Bousquet, J., Khasa, D.P. and MacKay, J. (2005) Recent advances in forest and tree genomics. In 29th Meeting of the Canadian Tree Improvement Association. PartI. Kelowna, British Columbia. (D. Simpson, Eds.) Canadian Forest Service, Fredericton, pages 45-49. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  12. Bousquet, J., Khasa, D.P., MacKay, J. and Tremblay, F.M. (2003) Recent advances in tree genomics and somatic embryogenesis. In 28th Meeting of the Canadian Tree Improvement Association. Part I. Edmonton, Alberta. (D. Simpson, Eds.) Canadian Forest Service, Fredericton, pages 45-50. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  13. Beaulieu, J.,, Bousquet, J., Rainville, A. and Zhang, S.Y. (2003) Le Québec à l’aube d’une révolution en génétique forestière. In Actes du Carrefour de la recherche forestière du Québec. La régénération forestière, les 25 prochaines années. Février, pages 5-16. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  14. Bousquet, J. and Tremblay, F.M. (2001) Recent advances in molecular forest genetics and somatic embryogenesis. In Proc. 27th Meeting of the Canadian Tree Improvement Association. Sault Ste.Marie, Ontario. (Simpson, D., Eds.) Pages 63-70. Canadian Forest Service, Fredericton. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  15. Beaulieu, J., Villeneuve, M. and Bousquet, J. (1998) Overview of progress in tree breeding in Québec with an emphasis on a selected group of conifer species. In Proc. 26th Meeting of the Canadian Tree Improvement Association. (Beaulieu, J. and Simpson, D., Eds.) Pages 2-15. Canadian Forest Service, Fredericton, New Brunswick. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  16. Roy, A., Forget, E. and Bousquet, J. (1998) Amélioration génétique de la teneur en sucre de la sève des érables à sucre (Acersaccharum Marsh.) par sélection assistée par marqueurs. In Comptes-rendus du Colloque «Les stress et la productivité de l'érable à sucre: de l'arbre au pleuplement». (Renaud, J-P. and Allard, G.B., Eds.) Pages 88-96. Centre de transfert technologique en acériculture, MAPAQ. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  17. Bousquet, J. and Tremblay, F.M. (1998) Forest genetics and somatic embryogenesis. In Proc. 26th Meeting of the Canadian Tree Improvement Association. (Beaulieu, J and Simpson, D., Eds.) Pages 72-78. Canadian Forest Service, Fredericton, New-Brunswick. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  18. Bousquet, J., Tremblay, F.M. and Isabel, N. (1996) Forest genetics and biotechnology advances at Laval University. In Proc. 25th Meeting of the Canadian Tree Improvement Association. (Lavereau, J., Eds.) Pages 112-118. Service canadien des forêts, Petawawa National Forestry Institute, Chalk River, Ontario. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  19. Khasa, P.D. and Bousquet, J. (1994) Genetic improvement of Racosperma spp. for agroforestry in sub-Saharan African countries. In Proc. 6th Conference of the African Association for Biological Nitrogen Fixation.Univ. of Zimbabwe, Mount Pleasant, Harare, Zimbabwe. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  20. Li, P., Beaulieu, J. and Bousquet, J. (1993) Developing provisional seed transfer guidelines for white spruce in Quebec. In Proc. of the Symposium on Research and Development on the genetics of white spruce in Quebec : from DNA to seed. Ste-Foy, Québec. Laurentian Forestry Centre, Canadian Forest Service. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  21. Isabel, N., Tremblay, F.M. and Bousquet, J. (1993) RAPD markers: a new tool in clonal population genetics. In Proc. of the Symposium on Research and Development on the genetics of white spruce in Quebec : from DNA to seed. Ste-Foy, Québec. Laurentian Forestry Centre, Canadian Forest Service. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  22. Bousquet, J. (1986) Utilisation de marqueurs biochimiques dans l'étude génétique des Betulaceae: perspectives. In Comptes-rendus du Colloque sur l'amélioration génétique des essences forestières. Univ. Montréal, Mai, pages 49-63. 54e Congrès ACFAS. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )


Rapports scientifiques, manuels et autres


  1. Costanza, A., Woeste, K., Bousquet, J., Goldfarb, B., Howe, G. and Peter, G. (2015) Forest Tree Adaptation: 8 gaps and initial recommendations. Technical report, Tree Genes Initiative, U.S. Forest Service & the Institute of Forest Biosciences, U.S.A. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  2. Bousquet, J. (2013) Considérations relativement à la mission de conservation et de mise en valeur du Site patrimonial de Sillery. Mémoire et présentation, Commission du patrimoine culturel du Québec, Québec. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  3. Desmeules, R., Léveillé, J.-P., Paradis, D., Bousquet, R., Bousquet, J., Bussières, G., Bussière, M., Comeau, P., Desjardins, Y., Desmeules, R., Dubé, C., Ferland, J., Gagnon, M., Germain, A., Lebel, S. and Tremblay, C. (2013) Plan directeur du patrimoine naturel du campus de l’Université Laval. Technical report, Université Laval. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  4. Kremer, A., Baker, A., Bousquet, J., Cervera, M.T., Fluch, S., Koskela, J., MacKay, J., Neale, D., Ritland, K., Savolainen, O., Vinceti, B., Wheeler, N. and Whitham, T.G. (2012) A roadmap for future transatlantic research cooperation on adaptation of forest trees to environmental change. Technical report, Institut national de recherches agronomiques (INRA), France. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  5. Bousquet, J. (2009) Propositions pour une meilleure considération du patrimoine arboricole. Mémoire, Refonte des règlements d’urbanisme de la Ville de Québec. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  6. Bousquet, J. (2007) Un règlement de protection des arbres pour le développement durable de Québec. Mémoire, Règlement d’abattage des arbres, Ville de Québec. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  7. Bousquet, J. and Perry, D.J. (2000) Genetic diversity of black spruce populations regenerated after fire or after harvesting with pre-established regeneration protection. Final Project Report 2000-28, Sustainable Forest Management Network, A Network of Centres of Excellence, Canada. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  8. Beaulieu, J., Gagnon, C., Roy, A., Li, P., Legare, S. and Bousquet, J. (1996) Développement et production de semences d'épinette blanche génétiquement supérieure pour la région du Bas Saint-Laurent/Gaspésie. Technical report Projet no l048, Essais, expérimentations et transfert technologique en foresterie (EETT), Ressources Naturelles Canada. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  9. Bousquet, J., Belanger, L., Desrochers, A. and Munson, A.D. (1996) Mémoire sur la politique du Ministère des Ressources naturelles sur la diversité biologique des forêts. Technical report, Centre de recherche en biologie forestière et Groupe de recherche en aménagement durable et intégré des forêts, Université Laval, Québec. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  10. Munson, A.D., Desrochers, A., Bousquet, J. and Belanger, L. (1995) Mémoire sur le Projet de stratégie québécoise de mise en oeuvre de la Convention sur la diversité biologique. Mémoire, Gouvernement du Québec, Ministère de l'environnement et de la faune. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )


Thèses, mémoires et essais


  1. Bousquet, J. (1989) Génétique des populations chez le genre Alnus. Thèse de doctorat, Université Laval. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  2. Bousquet, J. (1984) Variabilité infraspécifique de certaines caractéristiques juvénile de l'épinette blanche, Picea glauca (Moench) Voss. Mémoire de baccalauréat, Université Laval. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )


Thèses, mémoires et essais supervisés


  1. Stival Sena, J. (2017) Structural and functional evolution of genes in conifers. Thèse de doctorat, Université Laval. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  2. Cinget, B. (2015) Étude phylogéographique pancanadienne du sapin baumier (Abies balsamea [L.] Mill.) et de ses relations avec le sapin subalpin (Abies lasiocarpa [Hook] Nutt.) dans l’ouest du Canada. Thèse de doctorat, Université Laval. (URL  | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  3. Warren, E. (2015) Phylogéographie du mélèze laricin (Larix laricina [Du roi] K. Koch) en Amérique du Nord. Mémoire de maîtrise, Université Laval. (URL  | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  4. Tessier, G. (2014) Variation génétique chez l’épinette noire (Picea mariana): relier l’expression génique à la diversité génétique. Mémoire de maîtrise, Université Laval. (URL  | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  5. Prunier, J. (2012) Étude de l’adaptation au niveau moléculaire chez l’épinette noire (Picea mariana [Mill.] B.S.P.). Thèse de doctorat, Université Laval. (URL  | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  6. Godbout, J. (2011) Phylogéographie du pin gris (Pinus banksiana Lamb.) et du pin tordu (Pinus contorta Dougl. ex. Loud.). Thèse de doctorat, Université Laval. (URL  | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  7. Talbot, P. (2011) Hybridation naturelle entre les peupliers exotiques et indigènes dans les Prairies canadiennes. Mémoire de maîtrise, Université Laval. (URL  | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  8. Pickford, J. (2010) Caractérisation du cortège ectomycorhizien d'une plantation forestière et sylvopastorale d'Eucalyptus urograndis au Brésil. Mémoire de maîtrise, Université Laval. (URL  | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  9. Lemieux, M. (2010) Cytoplasmic DNA polymorphisms in eastern hemlock: Genogeographic analyses and implications for gene conservation. Mémoire de maîtrise, Université Laval. (URL  | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  10. Hinsinger, D. (2010) Diversité et évolution du genre Fraxinus. Thèse de doctorat, Université Laval. (URL  | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  11. Gerardi, S. (2009) Étude phylogéographique comparée des polymorphismes des génomes chloroplastique et mitochondrial de l'épinette noire. Mémoire de maîtrise, Université Laval. (URL  | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  12. Guigou Cairus, G. (2008) ESTIMATING GENETIC FLOW BETWEEN EXOTIC AND NATIVE POPLAR SPECIES IN QUÉBEC. Mémoire de maîtrise, Université Laval. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  13. Beauseigle, S. (2005) Cartographie génétique de l'épinette blanche (Picea glauca (Moensh) Voss). Mémoire de maîtrise, Université Laval. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  14. Gros-Louis, M.-C. (2004) Empreintes génomiques de typesnucléaires, mitochondrial etchloroplastique chez les mélèzes (Laris sp.). Mémoire de maîtrise, Université Laval. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  15. Jaramillo Correa, J.P. (2004) Diversité génétique mitochondriale chez Picea mariana : une analyse phylogéographique de son aire de répartition et de la zone de contact avec P. rubens. Thèse de doctorat, Université Laval. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  16. Pollefeys, P. (2003) Reconnaissance des cépages hybrides franco-américains à l'aide de marqueurs moléculaires. Mémoire de maîtrise, Université Laval. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  17. Gosselin, I. (2001) Cartographie génétique de l'épinette blanche (Picea glauca (Moench) Voss) à l'aide des marqueurs RAPD, ESTP et SCAR. Mémoire de maîtrise, Université Laval. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  18. Plante, S. (2001) Étude biosystématique du genre Bidens (Asteraceae) au Québec : espèces rares et taxons voisins. Thèse de doctorat, Université Laval. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  19. Richard, S. (1999) Analyse moléculaire de la réponse aux stress chez Picea glauca. Thèse de doctorat, Université Laval. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  20. Perron, M. (1999) Étude moléculaire du complexe d'espèces Picea mariana - P. rubens. Thèse de doctorat, Université Laval. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  21. Senneville, S. (1999) Diversité génétique et conservation de l'if du Canada (Taxus canadensis Marsh.) au Québec. Mémoire de maîtrise, Université Laval. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  22. Laroche, J. (1998) Évolution du génome mitochondrial chez les angiospermes : une analyse des taux de substitution et d'insertion-délétion de nucléotides. Thèse de doctorat, Université Laval. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  23. Morin, R. (1998) Diversité et structure génétique des populations de noyer cendré (Juglans cinerea L.). Thèse de doctorat, Université Laval. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  24. Forget, E. (1996) Variations environnementales et génétiques de la teneur en sucre de la sève de l'érable à sucre. Thèse de doctorat, Université Laval. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  25. Isabel, N. (1995) Génétique moléculaire des populations naturelles et clonales du genre Picea sp. Thèse de doctorat, Université Laval. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  26. Li, Y. (1995) Transformation of white spruce (Picea glauca (Moench.) Voss) using microprojectile bombardment. Thèse de doctorat, Université Laval. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  27. Savard, L. (1992) Approches moléculaires en biosystématique et phylogénie des plantes supérieures. Thèse de doctorat, Université Laval. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )


Articles publiés dans des revues sans comité de lecture


  1. Lenz, P., Beaulieu, J. and Bousquet, J. (2015) Genomic selection and application to spruce breeding – some revealing tools. SMarTForests Newsletter. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  2. Lenz, P., Beaulieu, J. and Bousquet, J. (2015) L’application de la sélection génomique pour l’amélioration génétique des épinettes – des outils prometteurs. SMarTForests Newsletter. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  3. Bousquet, J. (2013) L’histoire récente du Site patrimonial de Sillery et de ses grands domaines. Bulletin de la Société d’histoire de Sillery, 27(1):5-13. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  4. Isabel, N., Bousquet, J., Perinet, P., Meirmans, P. and Lee Thompson, S. (2009) Impact of exotic poplars on natural stands. Forest Health and Biodiversity News, 13:1-3. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  5. Bigue, B., Gagne, P., Zhang, T., MacKay, J., Perinet, P. and Bousquet, J. (2006) Génétique et qualité du bois chez les peupliers hybrides. Capsules du Réseau Ligniculture Québec, 1. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  6. Beaulieu, J., Godbout, J., Jaramillo-Correa, J.P. and Bousquet, J. (2006) On the track of the past of our conifers / Sur la trace du passé de nos conifères. Forest Health and Biodiversity News, 10(1):2-6. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  7. Beaulieu, J., Villeneuve, M. and Bousquet, J. (1998) Tree improvement: Its contribution to sustainable development. Dendrome, 4:4-6. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  8. Isabel, N., Theriault, P., Beaulieu, J. and Bousquet, J. (1997) Genetic diversity in Pinus strobus L. populations in Québec: RAPDs vs. Allozymes. American Journal of Botany, 84(supplement):S116-S117. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  9. Bousquet, J. (1997) Molecular Evolution. (Book review). Ecoscience, 4:563-564. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  10. Bousquet, J. (1995) Des machines moléculaires à voyager dans le temps. Interface, 5:27-42. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  11. Bousquet, J., Beaulieu, J. and Villeneuve, M. (1995) Diversité et amélioration génétiques des arbres forestiers. II- De la production des variétés améliorées à la conservation des ressources génétiques. L'Aubelle, 106(Cours de formation continue no 33 de l'Ordre des Ingénieurs forestiers du Québec). (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  12. Bousquet, J., Isabel, N., Beaulieu, J. and Carlson, J.E. (1994) Marker-aided selection for mature wood density in white spruce. Dendrome, 1(2):7. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  13. Bousquet, J., Beaulieu, J. and Villeneuve, M. (1994) Diversité et amélioration génétiques des arbres forestiers. I- Les fondements de l'amélioration génétique. L'Aubelle, 105(Cours de formation continue no 32 de l'Ordre des Ingénieurs forestiers du Québec). (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  14. Savard, L., Li, P., Michaud, M. and Bousquet, J. (1991) Potential of SSU and ITS of nuclear rRNA genes in phylogenetic analysis of seed plants. Plant Genetics Newsletter, 7:52. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  15. Bousquet, J. and Massicotte, H. (1990) Les forêts anciennes de l’Orégon ou comment vivre le déclin de l'empire américain. L'Aubelle, 78:15-20. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  16. Bousquet, J. (1987) Manipulations génétiques chez les plantes ligneuses. L'Aubelle, 60:10-11. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  17. Bousquet, J. (1987) A Primer of Population Genetics, 2nd ed: a review. Genetic Society of Canada Bulletin, 18:53. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  18. Bousquet, J. (1986) Electrophoretic technics in tree improvement programs. Journal of the International Union of Societies of Foresters, 23:7-8. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )


<< Jean-François Boucher | MembresReguliers | Robert L. Bradley >>

********************************************************** ***************** Facebook Twitter *********************** **********************************************************

Abonnez-vous à
l'Infolettre du CEF,
suivez-nous sur

et

et lisez les blogues
de nos membres!

********************************************************** ***************** Cours du CEF **************************** **********************************************************

Cours du CEF

Cours d’été en statistiques bayésiennes – Summer school in Bayesian statistics 
École d’été en statistiques bayésiennes. Maximum de 20 participants.
14 au 18 août | Orford Musique (à 30 minutes de Sherbrooke)
Aménagement des écosystèmes forestiers (ENV7010) 
14 au 25 août 2017, FERLD, Abitibi
Cours sur la complexité 
24-29 septembre 2017, Toscane, Italie

********************************************************** ***************** pub - Carapace ****************** **********************************************************

********************************************************** ***************** Maudite pub - Budworm ****************** **********************************************************

********************************************************** ***************** Maudite pub - Colibri **************************** **********************************************************

********************************************************** ***************** Maudite pub - NewForest **************************** **********************************************************

********************************************************** ********** Maudite pub 6 - Au coeur de l'arbre *********** **********************************************************

...Une exposition
virtuelle sur l'arbre!

********************************************************** ***************** Boîte à trucs *************** **********************************************************

CEF-Référence
La référence vedette !

Jérémie Alluard (2016) Les statistiques au moments de la rédaction 

  • Ce document a pour but de guider les étudiants à intégrer de manière appropriée une analyse statistique dans leur rapport de recherche.

Voir les autres...