Juan Carlos Villarreal Aguilar

Chercheur régulier
Systématiques des bryophytes, systématique moléculaire et évolutive, symbioses entre les plantes et cyanobactéries, génomique fonctionnelle
Université Laval
Faculté des sciences et de génie
Département de biologie
Pavillon Alexandre-Vachon, bureau 3038
1045 avenue de la Médecine
Québec (Québec)
G1V 0A6 Canada

Téléphone : 1-418-656-2131 poste 8265

Personnel

Directions d'étudiants


Codirections


Ancien personnel

Étudiants diplômés
FORMATION
  • Earl S. Tupper Fellow, Smithsonian Tropical Research Institute, Panama, 2015
  • Sibbald Fellow, Royal Botanic Garden, Edinburgh, Scotland, 2015
  • Formation postdoctorale. Institute of Systematic Botany-Munich Botanic Garden, l'Allemagne, 2014.
  • Ph. D. en biologie évolutive, University of Connecticut, USA, 2011.
  • M. Sc. en biologie des plantes, Southern Illinois University, USA, 2005.
  • B. Sc. en biologie, Universidad de Panama, Panama, 2003
THÈMES DE RECHERCHE

Mes travaux portent sur la systématique, la diversité, la phylogénie et les interactions symbiotiques entre des bryophytes et des bactéries en milieu tropical. Depuis mon arrivée en poste, ma recherche aborde également la biodiversité, la conservation et l’influence des changements climatiques sur les groupes d’organismes qui composent la majorité de la biomasse photosynthétique et la base de la chaîne alimentaire des régions boréales: les bryophytes et les lichens. Les bryophytes (hépatiques et mousses) et les lichens jouent un rôle fondamental dans les cycles biogéochimiques planétaires du carbone et de l’azote tant de façon directe que par leurs interactions avec le biome microbien.

PUBLICATIONS
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Livres



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Articles publiés dans des revues avec comité de lecture


  1. Villarreal, J.C., Duckett, J.G. and Pressel, S. (2017) Morphology, ultrastructure and phylogenetic affinities of the single-island endemic Anthoceros cristatus Steph. (Ascension Island). Journal of Bryology, 39(3):226-234. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  2. Renzaglia, K.S., Villarreal, J.C., Piatkowski, B.T., Lucas, J.R. and Merced, A. (2017) Hornwort stomata: Architecture and fate shared with 400-million-year-old fossil plants without leaves. Plant Physiology, 174(2):788-797. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  3. Söderström, L., Hagborg, A., Von Konrat, M., Bartholomew-Began, S., Bell, D., Briscoe, L., Brown, E., Cargill, D.C., Costa, D.P., Crandall-Stotler, B.J., Cooper, E.D., Dauphin, G., Engel, J.J., Feldberg, K., Glenny, D., Robbert Gradstein, S., He, X., Heinrichs, J., Hentschel, J., Ilkiu-Borges, A.L., Katagiri, T., Konstantinova, N.A., Larraín, J., Long, D.G., Nebel, M., Pócs, T., Puche, F., Reiner-Drehwald, E., Renner, M.A., Sass-Gyarmati, A., Schäfer-Verwimp, A., Moragues, J.G.S., Stotler, R.E., Sukkharak, P., Thiers, B.M., Uribe, J., Vána, J., Villarreal, J.C., Wigginton, M., Zhang, L. and Zhu, R.-L. (2016) World checklist of hornworts and liverworts. PhytoKeys, 59(1):1-828. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  4. Long, D.G., Forrest, L.L., Villarreal, J.C. and Crandall-Stotler, B.J. (2016) Taxonomic changes in marchantiaceae, corsiniaceae and cleveaceae (Marchantiidae, Marchantiophyta). Phytotaxa, 252(1):077-080. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  5. Ruklani, N.C.S., Rubasinghe, S.C.K. and Villarreal, J.C. (2016) Two New Records of Sri Lankan Hornworts, Notothylas javanica (Notothyladaceae) and Megaceros flagellaris (Dendrocerotaceae). Cryptogamie, Bryologie, 37(4):435-444. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  6. Long, D.G., Forrest, L.L., Villarreal, J.C. and Crandall-Stotler, B.J. (2016) The genus Aitchisoniella Kashyap (Marchantiopsida, Cleveaceae) new to China, and its taxonomic placement. Journal of Bryology, 38(4):308-311. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  7. Villarreal, J.C., Cargill, D.C., Soderstrom, L., Hagborg, A. and Von Konrat, M. (2015) Notes on Early Land Plants Today. 70. Nomenclatural notes in hornworts (Anthocerotophyta). Phytotaxa, 208(1):92-96. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  8. Li, F.-W., Melkonian, M., Rothfels, C.J., Villarreal, J.C., Stevenson, D.W., Graham, S.W., Wong, G.K.-S., Pryer, K.M. and Mathews, S. (2015) Phytochrome diversity in green plants and the origin of canonical plant phytochromes. Nature Communications, 6. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  9. Brown, R.C., Lemmon, B.E., Shimamura, M., Villarreal, J.C. and Renzaglia, K.S. (2015) Spores of relictual bryophytes: Diverse adaptations to life on land. Review of Palaeobotany and Palynology, 216:1-17. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  10. Villarreal, J.C., Cusimano, N. and Renner, S.S. (2015) Biogeography and diversification rates in hornworts: The limitations of diversification modeling. Taxon, 64(2):229-238. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  11. Ok, C., Yang, H., Villarreal, J.C., Barkoh, B.A., Routbort, M.J., Singh, R.R., Mantha, G.S., Lu, H., Medeiros, L., Luthra, R. and Patel, K.P. (2015) Development of a Decision Support System for Specimen Accessioning and Uniform Triaging of Oncologic Molecular Testing. Journal of Molecular Diagnostics, 17(6):803-804. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  12. Li, F.-W., Rothfels, C.J., Melkonian, M., Villarreal, J.C., Stevenson, D.W., Graham, S.W., Wong, G.K. -S., Mathews, S. and Pryer, K.M. (2015) The origin and evolution of phototropins. Frontiers in Plant Science, 6. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  13. Villarreal, J.C. and Renzaglia, K.S. (2015) The hornworts: Important advancements in early land plant evolution. Journal of Bryology, 37(3):157-170. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  14. Chantanaorrapint, S., Penjor, P. and Villarreal, J.C. (2015) Taxonomic notes on Phaeoceros himalayensis, with lectotypification of Anthoceros himalayensis. Phytotaxa, 231(2):193-196. (Scopus  | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  15. Forrest, L.L., Long, D.G., Cargill, D.C., Hart, M.L., Milne, J., Schill, D.B., Seppelt, R.D. and Villarreal, J.C. (2015) On Monocarpus (Monocarpaceae, Marchantiopsida), an isolated salt-pan complex thalloid liverwort. Australian Systematic Botany, 28(3):137-144. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  16. Sustaita, D, Owen, Christopher L., Villarreal, J.C. and Rubega, M.A. (2014) Morphometric tools for sexing loggerhead shrikes in california. The Southwestern Naturalist, 59(4):560-567. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  17. Wickett, N.J., Mirarab, S., Nam, N, Warnow, T., Carpenter, E., Matasci, N., Ayyampalayam, S., Barker, Mi.S., Burleigh, J. G., Gitzendanner, M.A., Ruhfel, B.R., Wafula, E., Der, Joshua P., Graham, S.W., Mathews, S., Melkonian, M., Soltis, D.E., Soltis, P.S., Miles, N.W., Rothfels, C.J., Pokorny, L., Shaw, A. J., DeGironimo, L., Stevenson, D.W., Surek, B., Villarreal, J.C., Roure, B., Philippe, H., dePamphilis, C.W., Chen, T., Deyholos, M.K., Baucom, R.S., Kutchan, T.M., Augustin, M.M., Wang, J., Zhang, Y., Tian, Z., Yan, Z., Wu, X., Sun, X., Wong, G.K.-S. and Leebens-Mack, J. (2014) Phylotranscriptomic analysis of the origin and early diversification of land plants. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 111(45):E4859-E4868. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  18. Villarreal, J.C. and Renner, S.S. (2014) A review of molecular-clock calibrations and substitution rates in liverworts, mosses, and hornworts, and a timeframe for a taxonomically cleaned-up genus Nothoceros. Molecular Phylogenetics and Evolution, 78:25-35. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  19. Matasci, N., Hung, L.-H., Yan, Z., Carpenter, E.J., Wickett, N.J., Mirarab, S., Nam N., Warnow, T., Ayyampalayam, S., Barker, M., Burleigh, J. G., Gitzendanner, M.A., Wafula, E., Der, J.P., dePamphilis, C.W., Roure, B., Philippe, H., Ruhfel, B.R., Miles, N.W., Graham, S.W., Mathews, S., Surek, B., Melkonian, M., Soltis, D.E., Soltis, P.S., Rothfels, C., Pokorny, L., Shaw, J.A., DeGironimo, L., Stevenson, D.W., Villarreal, J.C., Chen, T., Kutchan, T.M., Rolf, M., Baucom, R.S., Deyholos, M.K., Samudrala, R., Tian, Z., Wu, X., Sun, X., Zhang, Y., Wang, J., Leebens-Mack, J. and Wong, G.K.-S. (2014) Data access for the 1,000 Plants (1KP) project. Gigascience, 3. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  20. Li, F.-W., Villarreal, J.C., Kelly, S., Rothfels, C.J., Melkonian, M., Frangedakis, E., Ruhsam, M., Sigel, E.M., Der, J.P., Pittermann, J., Burge, D.O., Pokornyk, L., Larsson, A., Chen, T., Weststrand, S., Thomas, P., Carpenter, E., Zhang, Y., Tian, Z., Chen, L., Yan, Z., Zhu, Y., Sun, X., Wang, J., Stevenson, D.W., Crandall-Stotler, B.J., Shaw, A. J., Deyholos, Mi.K., Soltis, D.E., Graham, S.W., Windham, M.D., Langdale, J.A., Wong, G.K.-S., Mathews, S. and Pryer, K.M. (2014) Horizontal transfer of an adaptive chimeric photoreceptor from bryophytes to ferns. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 111(18):6672-6677. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  21. Villarreal, J.C., Forrest, L.L., Cooper, E. D. and Long, D.G. (2014) Phylogenetic affinities and conservation status of Telaranea murphyae Paton in Britain. Journal of Bryology, 36(3):191-199. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  22. Laenen, B., Shaw, B., Schneider, H., Goffinet, B., Paradis, E., Desamore, A., Heinrichs, J., Villarreal, J.C., Gradstein, S.R., McDaniel, S.F., Long, D.G., Forrest, L. L., Hollingsworth, M.L., Crandall-Stotler, B., Davis, E.C., Engel, J., Von Konrat, M., Cooper, E.D., Patino, J., Cox, C.J., Vanderpoorten, A. and Shaw, A.J. (2014) Extant diversity of bryophytes emerged from successive post-Mesozoic diversification bursts. Nature Communications, 5. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  23. Villarreal, J.C., Forrest, L.L., Wickett, N. and Goffinet, B. (2013) The plastid genome of the hornwort nothoceros aenigmaticus (dendrocerotaceae): phylogenetic signal in inverted repeat expansion, pseudogenization, and intron gain. American Journal of Botany, 100(3):467-477. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  24. Bainard, J.D. and Villarreal, J.C. (2013) Genome size increases in recently diverged hornwort clades. Genome, 56(8, 1, SI):431-435. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  25. Desiro, A.and Duckett, J.G., Pressel, S., Villarreal, J.C. and Bidartondo, M.I. (2013) Fungal symbioses in hornworts: a chequered history. Proceedings of the Royal Society B-Biological Sciences, 280(1759). (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  26. Villarreal, J.C. and Renner, S.S. (2013) Correlates of monoicy and dioicy in hornworts, the apparent sister group to vascular plants. BMC Evolutionary Biology, 13. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  27. Villarreal, J.C., Campos S, L.V., Uribe-M, J. and Goffinet, B. (2012) Parallel Evolution of Endospory within Hornworts: Nothoceros renzagliensis (Dendrocerotaceae), sp nov. Systematic Botany, 37(1):31-37. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  28. Johnson, M.T. J., Carpenter, E.J., Tian, Z., Bruskiewich, R., Burris, J.N., Carrigan, C.T., Chase, M.W., Clarke, N.D., Covshoff, S., dePamphilis, C.W., Edger, P.P., Goh, F., Graham, S., Greiner, S., Hibberd, J.M., Jordon-Thaden, I., Kutchan, T.M., Leebens-Mack, J., Melkonian, M., Miles, N., Myburg, H., Patterson, J., Pires, J. C., Ralph, P., Rolf, M., Sage, F., Soltis, D., Soltis, P., Stevenson, D., Stewart, Jr., C.N., Surek, B., Thomsen, C. J. M., Villarreal, J.C., Wu, X., Zhang, Y., Deyholos, M.K. and Wong, G.K.-S. (2012) Evaluating Methods for Isolating Total RNA and Predicting the Success of Sequencing Phylogenetically Diverse Plant Transcriptomes. PLoS ONE, 7(11). (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  29. Garcia, C., Sergio, C., Villarreal, J.C., Sim-Sim, M. and Lara, F. (2012) The hornworts Dendroceros Nees and Megaceros Campb. in Sao Tome e Principe (Africa, Gulf of Guinea) with the description of Dendroceros paivae sp nov. Cryptogamie, Bryologie, 33(1):3-21. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  30. Villarreal, J.C. and Renner, S.S. (2012) Hornwort pyrenoids, carbon-concentrating structures, evolved and were lost at least five times during the last 100 million years. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 109(46):18873-18878. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  31. Villarreal, J.C., Goffinet, B. and Duff, R. J.and Cargill, D.C. (2010) Phylogenetic delineation of Nothoceros and Megaceros (Dendrocerotaceae). Bryologist, 113(1):106-113. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  32. Villarreal, J.C., Cargill, D.C., Hagborg, A., Soderstrom, L. and Renzaglia, K.S. (2010) A synthesis of hornwort diversity: Patterns, causes and future work. Phytotaxa, 9:150-166. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  33. Beldomenico, P.M., Rey, F., Prado, W.S., Villarreal, J.C., Munoz-De-Toro, M. and Luque, E.H. (2007) In ovum exposure to pesticides increases the egg weight loss and decreases hatchlings weight of Caiman latirostris (Crocodylia : Alligatoridae). Ecotoxicology and Environmental Safety, 68(2):246-251. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )


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Jérémie Alluard (2016) Les statistiques au moments de la rédaction 

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