Louis Bernier

Membre régulier
Pathologie forestière

Université Laval
Faculté de foresterie, de géographie et de géomatique
Département des sciences du bois et de la forêt Pavillon Charles-Eugène Marchand, local 2263
1030 avenue de la Médecine
Québec (Québec) G1V 0A6
Canada

(418) 656-7655

Site départemental 

BIENVENUE DANS LA PAGE DU LABORATOIRE DE PATHOLOGIE FORESTIÈRE
FORMATION ACADÉMIQUE
  • Postdoctorat en génétique microbienne, 1989 (Université Laval)
  • Postdoctorat en biologie moléculaire des champignons, 1988 (Université de Bath, Royaume-Uni)
  • Ph.D. en pathologie forestière, 1989 (Université de Toronto)
  • M.Sc. en sciences forestières, 1983 (Université de Toronto)
  • B.Sc. en génie forestier, 1981 (Université Laval)
Actualités phytopathologiques

2015
  • Congrès: La saison des congrès est déjà enclenchée. En effet, Erika Sayuri Naruzawa et Martha Nigg ont présenté les résultats de leurs travaux sur le dimorphisme levure-mycélium chez Ophiostoma novo-ulmi dans le cadre du Fungal Genetics Meeting at Asilomar, une conférence qui se tient à tous les deux ans près de Monterey en Californie (on a déjà vu pire comme emplacement !). Les membres étudiants de l'équipe seront également très actifs lors des congrès estivaux. À suivre.
  • Stagiaire: Une stagiaire française, Aziyadé Cornet, se joint à notre équipe de février à août, dans le cadre de son stage de M2. Aziyadé est inscrite au Masters en mycologie à l’Université de Bordeaux et travaillera sur le dimorphisme chez Ophiostoma novo-ulmi.
  • Diplômés: Nicolas Nadeau Thibodeau a déposé en mars son mémoire de maîtrise, intitulé «Le chancre causé par l’Ophiognomonia clavigignenti-juglandacearum : protection et rétablissement du noyer cendré ». Danny Rioux et Pierre DesRochers, chercheurs scientifiques au service canadien de forêts, étaient les codirecteurs. Plus récemment (le 14 mai), Erika Sayuri Naruzawa soutenait avec succès sa thèse de doctorat sur les «Bases moléculaires du dimorphisme levure-mycélium chez le champignon phytopathogène Ophiostoma novo-ulmi ». Fabienne Malagnac, professeure à l’Université Paris Sud, était la codirectrice. Félicitations, Nicolas et Erika!
  • Génomes: Le génome nucléaire d' Ophiostoma novo-ulmi, qui avait auparavant été séquencé et assemblé (Journal of Biomolecular Techniques) , est maintenant annoté. Ce résultat excitant, fruit d’un travail d’équipe coordonné de main de maître par André Comeau qui a scruté les quelque 8640 gènes d' O. novo-ulmi, est décrit en détail dans une publication récente dans la revue Genome Biology & Evolution . Les génomes de deux champignons pathogènes des peupliers, Mycosphaerella populorum et M. populorum, font également l'objet d'une comparaison détaillée dans un article paru dans la revue Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA . Ce travail, auquel mon équipe a participé, était piloté par les équipes de R.C. Hamelin et P. Tanguay.
  • Nouvelle recrue: Julien Ponchart s'est officiellement joint à l'équipe. Julien étudie l'endomycobiome du sapin baumier dans le cadre d'un projet mené par Jean A. Bérubé, chercheur scientifique au service canadien des forêts.

2014

  • Stagiaires: des stagiaires belge (Jean-Bastien Van Brussel) et français (Martin Gavant), ainsi qu'une boursière de 1er cycle (Marie-Ève Wedge) ont participé activement à nos recherches en phytopathologie et en mycologie. Erika Sayuri Naruzawa s'est quant à elle illustrée lors du congrès de la Société de protection des plantes du Québec puisqu'elle s'est vu remettre la Bourse étudiante ainsi que le prix de la meilleure présentation étudiante.

2013

  • Congrès: Alors que l’été est généralement le temps fort pour les congrès, les membres de l’équipe ont plutôt profité de l’automne pour présenter leurs résultats à l’extérieur de la province. Jean-François Bourdon, qui faisait partie d’un contingent de 11 étudiants de l’U. Laval participant à la 105e assemblée annuelle de l’Institut forestier du Canada (IFC) tenue à Corner Brook (Terre-Neuve), s’est mérité le premier prix pour son affiche intitulée Remote sensing of forest fire severity in a morel harvesting perspective in boreal forest Bravo, Jean-François!

    Louis Bernier s’est pour sa part envolé pour Florence pour y présenter les résultats de plusieurs années de travaux par les membres de l’équipe, lors de la 3e Conférence internationale sur l’orme. La présentation, intitulée Genomics of the Dutch elm disease pathosystem: are we there yet?, est l’amorce d’un article de synthèse qui est depuis paru dans la revue iForest . Sitôt revenu d’Italie, il repartait pour le Brésil où on l’avait invité à présenter une conférence sur la génomique des champignons pathogènes des arbres dans le cadre du 46e Congrès brésilien de phytopathologie. Il n’y a pas que le patron qui a pu admirer la ville coloniale d’Ouro Preto où se tenait le congrès, puisque Erika Sayuri Naruzawa y a également présenté une présentation orale et une affiche.
  • Nouveaux visages en 2013: Plusieurs nouveaux arrivants se sont joints au laboratoire de pathologie forestière en cours d'année: un chercheur postdoctoral (André Comeau, originaire de la Nouvelle-Écosse), trois stagiaires (Daniele Arriel et Vanessa Lopes, en provenance du Brésil; Mialy Rabemanantsoa, originaire de La Réunion), une doctorante (Martha Nigg, franco-suisse) et un candidat à la maîtrise (Jean-François Bourdon, Québec).
  • Diplômés: Lauriane Varain a déposé en avril 2013 son mémoire de maîtrise, intitulé «Transformation avec la bactérie Agrobacterium tumefaciens de deux Ascomycètes Septoria musiva et Septoria populicola, agents phytopathogènes du peuplier». Philippe Tanguay, chercheur scientifique au service canadien de forêts, était le codireteur. Félicitations, Lauriane!

    Pour sa part, Joseph Djeugap Fovo a soutenu avec succès en juin sa thèse de doctorat qui portait sur les «Contraintes de germination et diagnostic moléculaire des champignons associés aux maladies chez Ricinodendron heudelotii au Cameroun». Joseph est professeur à l'Université de Dschang (Cameroun) où il enseigne et dirige des travaux de recherche en phytopathologie.
Personnel
Professionals
Josée Dufour
François Larochelle
Technicians
Donna Mazerolle

Graduate Student Advisor

Doctorates
Thais Campos de Oliveira
Jérôme Chapuis
Anna DiCarlo
Inès Nelly Moussavou Boussougou
Martha Nigg
Julien Ponchart
Marine Vautier
Master's
Jean-François Bourdon

Co-Advisor

Former Personnel
André Comeau (Postdoc 2013)
Volker Jacobi (Prof. de rech. 2011)
Jesus Diez (Postdoc 2010)

Former Students
Director
Erika Sayuri Naruzawa (Ph.D. 2015)
Nicolas Nadeau-Thibodeau (M.Sc. 2015)
Joseph Djeugap Fovo (Ph.D. 2013)
Lauriane Varain (M.Sc. 2013)
Agathe Vialle (Ph.D. 2011)
Karine Plourde (Ph.D. 2010)
Mirella Aoun (Ph.D. 2009)
Guillaume Bouvet (Ph.D. 2007)
François Paradis (M.Sc. 2007)
Marie-Eve Beaulieu (M.Sc. 2007)
Chantal Morin (Ph.D. 2006)
Marie-Eve Beaulieu (M.Sc. 2005)
Mathieu Allaire (M.Sc. 2004)
THÈMES DE RECHERCHE

La pathologie forestière s’intéresse à l’étude des maladies chez les arbres. Les principales maladies sont causées par des facteurs abiotiques (gel, sécheresse, verglas, etc.) ou par des facteurs biotiques (notamment des microorganismes tels champignons, bactéries, virus, etc.). Bien que les arbres et les peuplements forestiers puissent également subir des dégâts importants dus aux insectes, ces derniers ne sont pas considérés comme étant des pathogènes et leur étude relève de l’entomologie. Comme c’est le cas pour plusieurs disciplines, l’étude des maladies des arbres revêt un côté pratique visant à répondre à des questions bien précises : quels sont les principaux agents pathogènes attaquant les arbres sur un territoire donné? Quel est l’impact de ces agents? Comment peut-on les contrôler ou, à tout le moins, minimiser les pertes dues à leur activité? Au-delà de ces considérations plus pratiques, l’étude des maladies biotiques résultant de l’interaction entre un hôte (arbre) et un agent pathogène permet également de mener des recherches de nature beaucoup plus fondamentale, par exemple sur l’écologie des agents pathogènes, ou encore sur la co-évolution entre ces derniers et leur hôte. Le thème central de mes activités de recherche est l’étude des microorganismes pathogènes des arbres. Pour ce faire, nous avons recours à différentes approches propres à la phytopathologie, à la biologie moléculaire et à la génomique. De façon générale, les travaux effectués par les membres de mon équipe se divisent en trois volets :

  1. identification des microorganismes associés à des maladies n’ayant pas (ou peu) été documentées;
  2. étude de la structure et de la dynamique des populations des agents pathogènes;
  3. identification de gènes contribuant à la pathogénie et à la valeur adaptative (fitness).
A ce sujet, vous pouvez lire cet article récent paru dans "International Innovation".
 
RÉALISATIONS RÉCENTES

Au fil des ans, nous avons étudié plusieurs espèces de champignons responsables de maladies chez les arbres ou de colorations dans l’aubier et les produits forestiers. Voici un aperçu des travaux en cours.

Identification de champignons associés à des essences forestières du Gabon et du Cameroun

Dans le cadre du Projet d’appui à la formation en gestion des ressources naturelles dans le bassin du Congo , nous nous intéressons aux champignons causant des pathologies et des caries chez des essences forestières endémiques d’Afrique tropicale. La doctorante Ines Nelly Moussavou Boussougou fait appel au séquençage de gènes ADNr pour identifier les champignons responsables de caries et de pourridiés (maladies racinaires) chez Desbordia glaucescens, Scyphocephalium ochocoa et Paraberlinia bifoliata, trois essences faisant l’objet d’une exploitation commerciale au Gabon. Un autre doctorant, Joseph Djeugap Fovo, utilise la même approche pour identifier les champignons pathogènes du Ricinodendron heudelotii, une essence à fort potentiel agroforestier au Cameroun dont la domestication est cependant compliquée par des maladies affectant les différentes parties des plants.

Étude des champignons pathogènes des peupliers hybrides

Photo: Patrick Filiatrault

Les peupliers hybrides sont particulièrement intéressants pour la foresterie québécoise, en raison notamment de leur croissance rapide sous nos conditions climatiques (vous trouverez plus d'information au Réseau Ligniculture Québec ). Le programme d’amélioration des peupliers hybrides en place au Québec, sous l’égide de la Direction de la recherche forestière du Ministère des Ressources naturelles et de la Faune, a déjà constitué un catalogue de clones bien adaptés aux différentes zones bioclimatiques de la province et résistants aux ravageurs et aux maladies, notamment le chancre septorien causé par le champignon Mycosphaerella populorum, ainsi que la rouille des feuilles causée par des champignons appartenant au genre Melampsora. Afin d’aider les améliorateurs dans leur travail pour obtenir une résistance durable, il importe de développer les connaissances sur les facteurs contribuant à la pathogénie chez les champignons précités, ainsi que les facteurs contribuant à la résistance chez les peupliers.

Les travaux en cours sur le M. populorum visent à développer un système de transformation génétique pour la production de mutants chez ce champignon. Ces travaux ont été réalisés par Lauriane Varain dans le cadre d’un projet de maîtrise. L’obtention de ces mutants facilitera l’étude de la biologie du M. populorum. Par exemple, des mutants moins agressifs à l’endroit des peupliers permettraient d’identifier, chez M. populorum, des gènes contrôlant la pathogénie. Pour sa part, la doctorante Marine Vautier s’intéresse tout particulièrement aux mécanismes de défense activés chez les peupliers en réponse à M. populorum ou encore aux espèces du genre Melampsora. Ces travaux sont menés en étroite collaboration avec les chercheurs Philippe Tanguay et Armand Séguin du Service canadien des forêts.

Génomique des agents de la maladie hollandaise de l’orme

Les populations d’orme nord-américaines et européennes ont été décimées par deux pandémies successives, dont la plus récente est causée par le champignon ascomycète Ophiostoma novo-ulmi. Près d’un milliard d’ormes adultes ont été tués par ce parasite qui envahit les vaisseaux du xylème après y avoir été apporté par des vecteurs, en l’occurrence les scolytes de l’orme. Alors qu’on connaît bien le cycle de la maladie (appelée graphiose de l’orme, ou encore maladie hollandaise de l’orme - MHO), on ignore toujours comment O. novo-ulmi tue son hôte. L’identification formelle de facteurs contribuant à la pathogénie et à la valeur adaptative (fitness) chez ce champignon facilitera, à long terme, le développement de méthodes de lutte plus efficaces contre la MHO. Nous utilisons des méthodes ponctuelles ciblant des gènes spécifiques, ainsi que des méthodes à haut débit permettant une analyse plus systématique du génome fongique, aussi bien au plan structural (organisation) que fonctionnel (expression des gènes). L’analyse de séquences partielles (étiquettes) de gènes exprimés à des stades de croissance bien définis nous a d’abord permis d’identifier au-delà de 2000 gènes. Nous avons depuis obtenu la séquence complète du génome. Nous évaluons présentement la contribution de certains gènes à la fitness chez O. novo-ulmi. Pour ce faire, nous évaluons le pouvoir pathogène, la croissance et la reproduction chez des mutants produits en laboratoire. Nous nous intéressons également au dimorphisme levure-mycélium chez O. novo-ulmi qui, à l’instar de plusieurs autres champignons pathogènes des plantes ou des humains, a recours à deux modes de croissance lorsqu’il colonise son hôte. Nous croyons que la transition entre les modes de croissance unicellulaire (levuriforme) et multicellulaire (mycélienne) est un élément important de la pathogénie chez O. novo-ulmi. Les travaux des doctorantes Erika Sayuri Naruzawa et Martha Nigg devraient nous en apprendre plus à ce sujet d’ici peu.

Nous avons également identifié plus de 500 gènes exprimés chez l’orme américain (Ulmus americana) en réponse à l’infection par O. novo-ulmi. Qui sait, il s’y cache peut-être des gènes qui pourraient être sélectionnés ou manipulés en vue d’augmenter la résistance à la maladie chez cette espèce.

L'ÉQUIPE, VERSION 2010-2013


[Montage photo: Erika Sayuri Naruzawa]
DISTINCTIONS RÉCENTES
  • 2002 Gordon J. Green Outstanding Young Scientist Award, Société canadienne de phytopathologie
  • 2008 Hommage René-Pomerleau "Pionnier et Force vive de la pathologie forestière et moléculaire", Société de protection des plantes du Québec
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PUBLICATIONS
Books



Book chapters


  1. Bernier, L. and Smith, S.M. (2015) Pests and Pathogens in North American Forest Ecosystems. (Chap. 16) In Routledge Handbook of Forest Ecology. (Peh, K.S.-H. and Corlett, R.T. and Bergeron, Y., Eds.) Routledge, Oxford, UK. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  2. Massoumi Alamouti, S., Beaulieu, M.-E., Bernier, L. and Breuil, C. (2013) Ophiostomatoid associates of spruce-infesting bark beetles in North America (Chap. 10). In CBS Biodiversity Series 12. The Ophiostomatoid Fungi: Expanding Frontiers. (Seifert, K.A., de Beer, Z.W. and & Wingfield, M.J., Eds.) Utrecht, pages 119-130. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  3. Bernier, L. (2013) Towards Ophiostoma Genomics (Chap. 21). In CBS Biodiversity Series 12. The Ophiostomatoid Fungi: Expanding Frontiers. (Seifert, K.A., de Beer, Z.W. and Wingfield, M.J., Eds.) Utrecht, pages 235-242. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  4. Dewar, K., Bernier, L. and Levesque, R.C. (1996) Electrophoretic karyotyping in fungi. (Chap. 2) In Nonmammalian Genomic Analysis: A Practical Guide. (Birren, B. and Lai, E., Eds.) San Diego, CA, USA, Academic Press, pages 25-60. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  5. Bernier, L. (1993) Conventional and molecular genetic approaches to the study of pathogenicity in Ophiostoma ulmi sensu lato. (Chap. 22) In Dutch Elm Disease Research: Cellular and Molecular Approaches. (Sticklen, M.B. and Sherald, J.L., Eds.) New-York, USA, Springer-Verlag, pages 293-307. (Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )


Edited books and proceedings



Peer-reviewed articles


  1. Djeugap, F.J, Bernier, L., Dostaler, D. and Zena, D.R.G. (2016) First report of Lasiodiplodia theobromae causing shoot blight of Ricinodendron heudelotii seedlings in Cameroon. International Journal of Agronomy and Agricultural Research, 8:59-63. (Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  2. Nigg, M. and Bernier, L. (2016) From yeast to hypha: defining transcriptomic signatures of the morphological switch in the dimorphic fungal pathogen Ophiostoma novo-ulmi. BMC Genomics, 17(1):920. (URL  | Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  3. Naruzawa, E.S., Malagnac, F. and Bernier, L. (2016) Effect of linoleic acid on reproduction and yeast–mycelium dimorphism in the Dutch elm disease pathogens. Botany, 94(1):31-39. (URL  | Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  4. Sherif, S. M., Shukla, M. R., Murch, S. J., Bernier, L. and Saxena, P. K. (2016) Simultaneous induction of jasmonic acid and disease-responsive genes signifies tolerance of American elm to Dutch elm disease. Scientific Reports, 6:21934-. (URL  | Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  5. Wedge, M.-E., Naruzawa, E.S., Nigg, M. and Bernier, L. (2016) Diversity in yeast-mycelium dimorphism response of the dutch elm disease pathogens: The inoculum size effect. Canadian Journal of Microbiology, 62(6):525-529. (Scopus  | Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  6. Comeau, A.M., Vincent, W.F., Bernier, L. and Lovejoy, C. (2016) Novel chytrid lineages dominate fungal sequences in diverse marine and freshwater habitats. Scientific Reports, 6:30120-. (URL  | Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  7. Bernier, L. (2016) Genome-wide analysis of parasitic fitness traits in a non-model tree pathogen. Canadian Journal of Plant Pathology, 38(2):153-163. (URL  | Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  8. Comeau, A.M., Dufour, J., Bouvet, G.F., Jacobi, V., Nigg, M., Henrissat, B., Laroche, J., Levesque, R.C. and Bernier, L. (2015) Functional Annotation of the Ophiostoma novo-ulmi Genome: Insights into the Phytopathogenicity of the Fungal Agent of Dutch Elm Disease. Genome Biology and Evolution, 7(2):410-430. (URL  | Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  9. Dhillon, B., Feau, N., Aerts, A.L., Beauseigle, S., Bernier, L., Copeland, A., Foster, A., Gill, N., Henrissat, B., Herath, P., LaButti, K.M., Levasseur, A., Lindquistb, E.A., Majoor, E., Ohm, R.A., Pangilinan, J.L., Pribowo, A., Saddler, J.N., Sakalidis, M.L., De Vries, R.P., Grigoriev, I.V., Goodwin, S.B., Tanguay, P. and Hamelin, R.C. (2015) Horizontal gene transfer and gene dosage drives adaptation to wood colonization in a tree pathogen. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 112(11):3451-3456. (Scopus  | Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  10. Djeugap, F.J., Bernier, L., Dostaler, D. and Zena, D.R.G. (2015) Chemical Control of Shoot Blight [Lasiodiplodia theobromae (Pat.) Griffon & Maubl.] Infecting Ricinodendron heudelotii Seedlings in Cameroon. International Journal of Current Research in Biosciences and Plant Biology, 2:82-87. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  11. Nigg, M., Laroche, J., Landry, C.R. and Bernier, L. (2015) RNAseq Analysis Highlights Specific Transcriptome Signatures of Yeast and Mycelial Growth Phases in the Dutch Elm Disease Fungus Ophiostoma novo-ulmi. G3: Genes|Genomes|Genetics, 5(11):2487-2495. (URL  | Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  12. Bernier, L., Aoun, M., Bouvet, G.F., Comeau, A.M., Dufour, J., Naruzawa, E.S., Nigg, M. and Plourde K.V. (2015) Genomics of the Dutch elm disease pathosystem: are we there yet? iForest-Biogeosciences and Forestry, 8(2):149-157. (URL  | Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  13. Plourde, K.V. and Bernier, L. (2014) A rapid virulence assay for the Dutch elm disease fungus Ophiostoma novo-ulmi by inoculation of apple (Malus × domestica ‘Golden Delicious’) fruits. Plant Pathology, 63(5):1078-1085. (URL  | Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  14. Djeugap, F.J., Bernier, L., Dostaler, D., Fontem, D.A. and Avana, M.L. (2014) Germination constraints on Ricinodendron heudelotii in Cameroon. Seed Technology, 36:61-72. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  15. Naruzawa, E.S. and Bernier, L. (2014) Control of yeast-mycelium dimorphism in vitro in Dutch elm disease fungi by manipulation of specific external stimuli. Fungal Biology, 118(11):872 - 884. (URL  | Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  16. Vialle, A., Feau, N., Frey, P., Bernier, L. and Hamelin, R.C. (2013) Phylogenetic species recognition reveals host-specific lineages among poplar rust fungi. Molecular Phylogenetics and Evolution, 66(3):628-644. (Scopus  | Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  17. Forgetta, V., Leveque, G., Dias, J., Grove, D., Lyons Jr., R., Genik, S., Wright, C., Singh, S., Peterson, N., Zianni, M., Kieleczawa, J., Hintz, W., Jacobi, V., Bernier, L., Levesque, R. and Dewar, K. (2013) Sequencing of the Dutch Elm Disease Fungus Genome Using the Roche/454 GS-FLX Titanium System in a Comparison of Multiple Genomics Core Facilities. Journal of Biomolecular Techniques, 24(2):39-49. (URL  | Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  18. Djeugap Fovo, J., Bernier, L., Dostaler, D., Khasa, D.P., Fontem, D.A. and Nwaga, D. (2013) Opportunités et contraintes agroforestières de Ricinodendron heudelotii au Cameroun. International Journal of Biological and Chemical Sciences, 7:344-355. (Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  19. Cacas, J.-L., Petitot, A.-S., Bernier, L., Estevan, J., Conejero, G., Mongrand, S. and Fernandez, D. (2011) Identification and characterization of the Non-race specific Disease Resistance 1 (NDR1) orthologous protein in coffee. BMC Plant Biology, 11(1):144. (URL  | Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  20. Hintz, W., Pinchback, M., de la Bastide, P., Burgess, S., Jacobi, V., Hamelin, R., Breuil, C. and Bernier, L. (2011) Functional categorization of unique expressed sequence tags obtained from the yeast-like growth phase of the elm pathogen Ophiostoma novo-ulmi. BMC Genomics, 12(1):431. (URL  | Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  21. Vialle, A., Frey, P., Hambleton, S., Bernier, L. and Hamelin, R. (2011) Poplar rust systematics and refinement of Melampsora species delineation. Fungal Diversity, 50(1):227-248. (URL  | Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  22. Jacobi, V., Dufour, J., Bouvet, G.F., Aoun, M. and Bernier, L. (2010) Identification of transcripts up-regulated in asexual and sexual fruiting bodies of the Dutch elm disease pathogen Ophiostoma novo-ulmi. Canadian Journal of Microbiology, 56(8):697-705. (Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  23. Aoun, M., Jacobi, V., Boyle, B. and Bernier, L. (2010) Identification and monitoring of Ulmus americana transcripts during in vitro interactions with the Dutch elm disease pathogen Ophiostoma novo-ulmi. Physiological and Molecular Plant Pathology, 74(3-4):254-266. (Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  24. Feau, N., Mottet, M.-J., Perinet, P., Hamelin, R.C. and Bernier, L. (2010) Recent advances related to poplar leaf spot and canker caused by Septoria musiva. Canadian Journal of Plant Pathology, 32(2):122-134. (URL  | Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  25. Aoun, M., Rioux, D., Simard, M. and Bernier, L. (2009) Fungal Colonization and Host Defense Reactions in Ulmus americana Callus Cultures Inoculated with Ophiostoma novo-ulmi. Phytopathology, 99(6):642-650. (Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  26. Temple, B., Bernier, L. and Hintz, W.E. (2009) Characterisation of the polygalacturonase gene of the Dutch elm disease pathogen Ophiostoma novo-ulmi. New Zealand Journal of Forestry Science, 39(1):29-37. (Scopus  | Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  27. LeBoldus, J.M., Blenis, P.V., Thomas, B.R., Feau, N. and Bernier, L. (2009) Susceptibility of Populus balsamifera to Septoria musiva: A Field Study and Greenhouse Experiment. Plant Disease, 93(11):1146-1150. (Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  28. Stanosz, G., Smith, D. and Bernier, L. (2009) First report of Erysiphe palczewskii powdery mildew of Siberian pea tree (Caranga arborescens) in Wisconsin and Quebec. Plant Disease, 93(12):1352. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  29. Germain, H., Bergeron, M.-J., Bernier, L., Laflamme, G. and Hamelin, R.C. (2009) Patterns of colonization and spread in the fungal spruce pathogen Onnia tomentosa. Molecular Ecology, 18(21):4422-4433. (Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  30. Bouvet, G.F., Jacobi, V., Plourde, K.V. and Bernier, L. (2008) Stress-induced mobility of OPHIO1 and OPHIO2, DNA transposons of the Dutch elm disease fungi. Fungal Genetics and Biology, 45(4):565-578. (URL  | Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  31. Plourde, K., Jacobi, V. and Bernier, L. (2008) Use of insertional mutagenesis to tag putative parasitic fitness genes in the Dutch elm disease fungus Ophiostoma novo-ulmi subsp. novo-ulmi. Canadian Journal of Microbiology, 54(9):797-802. (Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  32. Bourassa, M., Bernier, L. and Hamelin, R.C. (2007) Genetic Diversity in Poplar Leaf Rust (Melampsora medusae f. sp. deltoidae) in the Zones of Host Sympatry and Allopatry. Phytopathology, 97(5):603-610. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  33. Feau, N., Hamelin, R. and Bernier, L. (2007) Variability of Nuclear SSU-rDNA Group Introns Within Septoria Species: Incongruence with Host Sequence Phylogenies. Journal of Molecular Evolution, 64(5):489-499. (Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  34. Vujanovic, V., Hamelin, R. C., Bernier, L., Vujanovic, G. and St-Arnaud, M. (2007) Fungal diversity, dominance, and community structure in the rhizosphere of clonal Picea mariana plants throughout nursery production chronosequences. Microbial Ecology, 54(4):672-684. (Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  35. Morin, C., Couturier, S. and Bernier, L. (2007) Pathogenicity of wild-type and albino strains of the fungus Ceratocystis resinifera, a potential biocontrol agent against bluestain. Canadian Journal of Forest Research, 37(5):919-930. (Scopus  | Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  36. Bouvet, G.F., Jacobi, V. and Bernier, L. (2007) Characterization of three DNA transposons in the Dutch elm disease fungi and evidence of repeat-induced point (RIP) mutations. Fungal Genetics and Biology, 44(5):430-443. (Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  37. Feau, N., Jacobi, V., Hamelin, R.C. and Bernier, L. (2006) Screening of ESTs from Septoria musiva (teleomorph Mycosphaerella populorum) for detection of SSR and PCR-RFLP markers. Molecular Ecology Notes, 6(2):356-358. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  38. Tanguay, P., Loppnau, P., Morin, C., Bernier, L. and Breuil, C. (2006) A spontaneous albino mutant of Ceratocystis resinifera results from a point mutation in the polyketide synthase gene, PKS1. Canadian Journal of Microbiology, 52(6):501-507. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  39. Morin, C., Tanguay, P., Breuil, C., Yang, D.Q. and Bernier, L. (2006) Bioprotection of spruce logs against sapstain using an albino strain of Ceratocystis resinifera. Phytopathology, 96(5):526-533. (Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  40. Feau, N., Hamelin, R.C. and Bernier, L. (2006) Attributes and congruence of three molecular data sets: Inferring phylogenies among Septoria-related species from woody perennial plants. Molecular Phylogenetics and Evolution, 40(3):808-829. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  41. Feau, N., Hamelin, R.C., Vandecasteele, C., Stanosz, G.R. and Bernier, L. (2005) Genetic structure of Mycosphaerella populoram (Anamorph Septoria musiva) Populations in north-central and northeastern north America. Phytopathology, 95(6):608-616. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  42. Bourassa, M., Bernier, L. and Hamelin, R.C. (2005) Direct genotyping of the poplar leaf rust fungus, Melampsora medusae f. sp deltoidae, using codominant PCR-SSCP markers. Forest Pathology, 35(4):245-261. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  43. Ouellette, G.B., Cherif, M., Simard, M. and Bernier, L. (2005) Histopathology of Fusarium wilt of staghorn sumac (Rhus typhina) caused by Fusarium oxysporum f. s.p. callistephi race 3. I. Modes of tissue colonization and pathogen peculiarities. Phytoprotection, 86(3):157-174. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  44. Et-Touil, A., Rioux, D., Mathieu, F.M. and Bernier, L. (2005) External symptoms and histopathological changes following inoculation of elms putatively resistant to Dutch elm disease with genetically close strains of Ophiostoma. Canadian Journal of Botany, 83(6):656-667. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  45. Feau, N., Weiland, J.E., Stanosz, G.R. and Bernier, L. (2005) Specific and sensitive PCR-based detection of Septoria musiva, S-populicola and S-populi, the causes of leaf spot and stem canker on poplars. Mycological Research, 109:1015-1028. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  46. Morin, C., Breuil, C. and Bernier, L. (2004) Genetic variability and structure of Canadian populations of the sapstain fungus Ceratocystis resinifera. Phytopathology, 94(12):1323-1330. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  47. Bernier, L. (2004) Genomics of ophiostomatoid fungi: the first two thousand genes. Phytoprotection, 85(1):39-43. (Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  48. Feau, N. and Bernier, L. (2004) First report of shining willow as a host plant for Septoria musiva. Plant Disease, 88(7):770-770. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  49. Filion, M., Hamelin, R.C., Bernier, L. and St-Arnaud, M. (2004) Molecular profiling of rhizosphere microbial communities associated with healthy and diseased black spruce (Picea mariana) seedlings grown in a nursery. Applied and Environmental Microbiology, 70(6):3541-3551. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  50. Tadesse, Y., Bernier, L., Hintz, W.E. and Horgen, P.A. (2003) Real time RT-PCR quantification and Northern analysis of cerato-ulmin (CU) gene transcription in different strains of the phytopathogens Ophiostoma ulmi and O. novo-ulmi. Molecular Genetics and Genomics, 269(6):789-796. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  51. Tanguay, P., Coupal, J. and Bernier, L. (2003) Genetic transformation, electrophoretic karyotyping and isolation of insertional mutants in the tree pathogenic fungus Neonectria galligena. Forest Pathology, 33(6):413-428. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  52. Gargouri, S., Bernier, L., Hajlaoui, M.R. and Marrakchi, M. (2003) Genetic variability and population structure of the wheat foot rot fungus, Fusarium culmorum, in Tunisia. European Journal of Plant Pathology, 109(8):807-815. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  53. Germain, H., Laflamme, G., Bernier, L., Boulet, B. and Hamelin, R.C. (2002) DNA polymorphism and molecular diagnosis in Inonotus spp. Canadian Journal of Plant Pathology, 24(2):194-199. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  54. Reyes, I., Bernier, L. and Antoun, H. (2002) Rock phosphate solubilization and colonization of maize rhizosphere by wild and genetically modified strains of Penicillium rugulosum. Microbial Ecology, 44(1):39-48. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  55. Plante, F., Hamelin, R.C. and Bernier, L. (2002) A comparative study of genetic diversity of populations of Nectria galligena and N-coccinea var. faginata in North America. Mycological Research, 106:183-193. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  56. Reyes, I., Baziramakenga, R., Bernier, L. and Antoun, H. (2001) Solubilization of phosphate rocks and minerals by a wild-type strain and two UV-induced mutants of Penicillium rugulosum. Soil Biology and Biochemistry, 33(12-13):1741-1747. (Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  57. Cheng, Y., Belzile, F., Tanguay, P., Bernier, L. and Belanger, R. (2001) Establishment of a gene transfer system for Pseudozyma flocculosa, an antagonistic fungus of powdery mildew fungi. Molecular Genetics and Genomics, V266(1):96-102. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  58. Kaboré, B.K., Couture, L., Dostaler, D. and Bernier, L. (2001) Variabilité phénétique du Colletotrichum graminicola du sorgho. Canadian Journal of Plant Pathology, 23(2):138-145. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  59. Gagne, P., Yang, D.Q., Hamelin, R.C. and Bernier, L. (2001) Genetic Variability of Canadian Populations of the Sapstain Fungus Ophiostoma piceae. Phytopathology, 91(4):369-376. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  60. Ouellette, G.B., Rioux, D., Bussieres, G., Simard, M. and Bernier, L. (2000) Extracellular sheath formation by Sphaeropsis hypodermia and association with its infection in elm trees. Phytoprotection, 81(2):69-86. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  61. Uzunovic, A., Yang, D.Q., Gagne, P., Breuil, C., Bernier, L., Byrne, A., Gignac, M. and Kim, S.H. (1999) Fungi that cause sapstain in Canadian softwoods. Canadian Journal of Microbiology, 45:914–922. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  62. Reyes, I., Bernier, L., Simard, R.R. and Antoun, H. (1999) Effect of nitrogen source on the solubilization of different inorganic phosphates by an isolate of Penicillium rugulosum and two UV-induced mutants. FEMS Microbiology Ecology, 28(3):281-290. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  63. Gosselin, L., Jobidon, R. and Bernier, L. (1999) Genetic variability and structure of Canadian populations of Chondrostereum purpureum, a potential biophytocide. Molecular Ecology, 8(1):113-122. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  64. Reyes, I., Bernier, L., Simard, R.R., Tanguay, P. and Antoun, H. (1999) Characteristics of phosphate solubilization by an isolate of a tropical Penicillium rugulosum and two UV-induced mutants. FEMS Microbiology Ecology, 28(3):291-295. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  65. Gosselin, L., Jobidon, R. and Bernier, L. (1999) Biological Control of Stump Sprouting of Broadleaf Species in Rights-of-Way with Chondrostereum purpureum: Incidence of the Disease on Nontarget Hosts. Biological Control, 16:60-67. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  66. Yang, D.Q., Gagne, P., Uzunovic, A., Gignac, M. and Bernier, L. (1999) Development of fungal stain in logs of three Canadian softwoods. Forest Products Journal, 49(2):39-42. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  67. Et-touil, K., Bernier, L., Beaulieu, J., Berube, J.A., Hopkin, A. and Hamelin, R.C. (1999) Genetic Structure of Cronartium ribicola Populations in Eastern Canada. Phytopathology, 89(10):915-919. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  68. Et-Touil, A., Brasier, C.M. and Bernier, L. (1999) Localization of a pathogenicity gene in Ophiostoma novo-ulmi and evidence that it may be introgressed from O-ulmi. Molecular Plant-Microbe Interactions, 12(1):6-15. (Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  69. Dewar, K., Bousquet, J., Dufour, J. and Bernier, L. (1997) A meiotically reproducible chromosome length polymorphism in the ascomycete fungus Ophiostoma ulmi (sensu lato). Molecular and General Genetics, 255(1):38-44. (Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  70. Plante, F. and Bernier, L. (1997) Variability of virulence of Nectria galligena towards northern hardwoods. European Journal of Forest Pathology, 27(4):261-272. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  71. Temple, B., Horgen, P.A., Bernier, L. and Hintz, W.E. (1997) Cerato-ulmin, a hydrophobin secreted by the causal agents of Dutch elm disease, is a parasitic fitness factor. Fungal Genetics and Biology, 22(1):39-53. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  72. Gosselin, L., Jobidon, R. and Bernier, L. (1996) Assessment of genetic variation within Chondrostereum purpureum from Quebec by random amplified polymorphic DNA analysis. Mycological Research, 100:151-158. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  73. Yang, D.Q. and Bernier, L. (1996) Production and use of calli from yellow birch buds for in vitro assessment of virulence of Nectria galligena isolates. Plant Cell, Tissue and Organ Culture, 45(2):175-177. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  74. Bernier, L., Yang, D., Ouellette, G.B. and Dessureault, M. (1996) Assessment of Phaeotheca dimorphospora for biological control of the Dutch elm disease pathogens, Ophiostoma ulmi and O. novo-ulmi doi:10.1046/j.1365-3059.1996.d01-161.x. Plant Pathology, 45(4):609-617. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  75. Yang, D.Q., Laflamme, G., Bernier, L. and Dessureault, M. (1995) Phaeotheca dimorphospora as a potential biocontrol agent for shoot blight caused by Gremmeniella abietina. Canadian Journal of Plant Pathology, 17(1):7-12. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  76. Yang, D.Q., Bernier, L. and Dessureault, M. (1995) Phaeotheca dimorphospora increases Trichoderma harzianum density in soil and suppresses red pine damping-off caused by Cylindrocladium scoparium. Canadian Journal of Botany, 73(5):693-700. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  77. Dewar, K. and Bernier, L. (1995) Inheritance of chromosome-length polymorphisms in Ophiostoma ulmi (sensu lato). Current Genetics, 27(6):541-549. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  78. Bernier, L., Hamelin, R.C. and Ouellette, G.B. (1994) Comparison of ribosomal DNA length and restriction site polymorphisms in Gremmeniella and Ascocalyx isolates. Applied and Environmental Microbiology, 60(4):1279-1286. (Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  79. Bernier, L. and Hubbes, M. (1994) Induction and genetic characterization of ultraviolet-sensitive mutants in the elm tree pathogen Ophiostoma ulmi(sensu lato). Mycological Research, 98:943-953. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  80. Yang, D.Q., Bernier, L. and Dessureault, M. (1994) Biological control of Septoria leaf spot of poplar by Phaeotheca dimorphospora. Plant Disease, 78(8):821-825. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  81. Dewar, K. and Bernier, L. (1993) Electrophoretic karyotypes of the elm tree pathogen Ophiostoma ulmi (sensu lato). Molecular Genetics and Genomics, 238(1):43-48. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  82. Hamelin, R.C., Ouellette, G.B. and Bernier, L. (1993) Identification of Gremmeniella abietina Races with Random Amplified Polymorphic DNA Markers. Applied and Environmental Microbiology, 59(6):1752-1755. (Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  83. Yang, D.Q., Plante, F., Bernier, L., Piche, Y., Dessureault, M., Laflamme, G. and Ouellette, G.B. (1993) Evaluation of a Fungal Antagonist, Phaeotheca-Dimorphospora, for Biological-Control of Tree Diseases. Canadian Journal of Botany, 71(3):426-433. (Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  84. Bernier, L. and Hubbes, M. (1990) Mutations in Ophiostoma ulmi induced by N-methyl-N'-nitro-N-nitrosoguanidine. Canadian Journal of Botany, 68(2):225-231. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  85. Bernier, L. and Hubbes, M. (1990) Meiotic analysis of induced mutations in Ophiostoma ulmi. Canadian Journal of Botany, 68(2):232-235. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  86. Bernier, L., Cooper, R.M., Charnley, A.K. and Clarkson, J.M. (1989) Transformation of the entomopathogenic fungus Metarhizium anisopliae to benomyl resistance doi:10.1111/j.1574-6968.1989.tb03483.x. FEMS Microbiology Letters, 60(3):261-266. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  87. Jeng, R.S., Bernier, L. and Brasier, C.M. (1988) A comparative study of cultural and electrophoretic characteristics of the Eurasian and North American races of Ophiostoma ulmi. Canadian Journal of Botany, 66(7):1325-1333. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  88. Bernier, L., Jeng, R.S. and Hubbes, M. (1983) Differentiation of aggressive and non-aggressive strains of Ceratocystis ulmi by polyacrylamide gel electrophoresis of intramycelial enzymes. Mycotaxon, 17:456–72. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )


Articles published in proceedings


  1. Aoun, M., Jacobi, V., Boyle, B., Rioux, D., Simard, M. and Bernier, L. (2009) Identification and profiling of American elm genes involved in a compatible interaction with the fungal pathogen Ophiostoma novo-ulmi. In Proceedings of the XIV MPMI Congress. Quebec (QC), Canada. (Antoun, H., Avis, T.J., Brisson, L., Prévost, D. and Trepanier, M., Eds.) (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  2. Tsui, C.K.M., Alamouti, S.M., Bernier, L., Bohlmann, J., Breuil, C. and Hamelin, R.C. (2009) Population structure of Grosmannia clavigera, a pine pathogen associated with mountain pine beetle. In Canadian Journal of Plant Pathology. jan. Canadian Phytopathological Soc, pages 139-139. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  3. Plourde, K.V., Jacobi, V. and Bernier, L. (2008) Recovery and functional analysis of six contiguous genes that may affect parasitic fitness in the Dutch elm disease fungus Ophiostoma novo-ulmi. In Phytopathology. jun, S126-S126. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  4. Morin, C. and Bernier, L. (2007) Protection biologique du bois contre le bleuissement à l’aide d’une souche albinos du champignon de bleuissement Ceratocystis resinifera. In Actes du colloque sur la lutte biologique et intégrée Protéger la forêt…naturellement. (Ressources naturelles Canada, Eds.) Pages 64-67. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  5. Bernier, L. (2006) Structural and Functional Genomics of Dutch Elm Disease Fungi. In Genomics for future forests. First Canadian forest genomics symposium. Ottawa. (Bonfils, A.-C., Gamache, I., Eds.) Natural Resources Canada, Canadian Forest Service, Headquarters, pages 57-60. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  6. Bernier, L. (2004) Génomique des champignons ophiostomatoïdes : un gène, c’est bien; deux, c’est mieux; deux mille, c’est encore mieux! In Phytoprotection. (Societe de protection des plantes du Quebec, Eds.) Pages 40-43. (Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  7. Bernier, L., Breuil, C., Hintz, W.E., Horgen, P.A., Jacobi, V., Dufour, J., Aoun, M., Bouvet, G., Kim, S.H., Diguistini, S., Tanguay, P., Eades, J., Burgess, S., de la Bastide, P., Pinchback, M. and Tadesse, Y. (2004) The Canadian Ophiostoma Genome Project. In Investigación agraria. Sistemas y recursos forestales. Pages 105-117. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  8. Bernier, L., Feau, N., Gagne, P., Mottet, M.J., Perinet, P. and Hamelin, R.C. (2003) L’établissement et la protection des plantations. In Actes Colloques du Carrefour de la recherche forestière. Quebec. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  9. Messier, C., Bigue, B. and Bernier, L. (2003) Using fast-growing plantations to promote forest ecosystem protection in Canada. In Forest management at the XII World Forestry Congress. (FAO, Unasylva, Eds.) Pages 59-63. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  10. Bernier, L., Plante, F., Plante, D., Tanguay, P. and Camy, C. (1998) Pathogenic variability of Nectria galligena. In Foliage, Shoot and Stem Diseases in Forest Trees. Canadian Forest Service, Quebec. (Laflamme, G., Berube, J.A., Hamelin, R.C., Eds.) Pages 140-149. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  11. Bernier, L., Hamelin, R.C., Lecours, N. and Ouellette, G.B. (1995) Use of nucleic acid and isoenzyme polymorphisms for taxonomic and population studies of Gremmeniella spp. In Shoot and Foliage Diseases in Forest Trees. Florence, Italy. (Capretti, P., Heiniger, U., Stephan, R., Eds.) Pages 198-203. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )


Scientific reports, manuals and others



Theses, dissertations and essays


  1. Bernier, L. (1989) Induction, characterization and mapping of mutations in Ophiostoma ulmi, the causal agent of Dutch elm disease. PhD thesis, Faculty of Forestry, University of Toronto. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  2. Bernier, L. (1983) Relationships between isoenzymes, cultural characters, and pathogenicity in Ceratocystis ulmi (Buism.) C. Moreau. Master's thesis, Faculty of Forestry, University of Toronto. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )


Supervised theses, dissertations and essays


  1. Naruzawa, E. S. (2015) Bases moléculaires du dimorphisme levure-mycélium chez le champignon phytopathogène Ophiostoma novo-ulmi. PhD thesis, Université Laval. (Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  2. Nadeau-Thibodeau, N. (2015) Le chancre causé par l’Ophiognomonia clavigignenti-juglandacearum : protection et rétablissement du noyer cendré. Master's thesis, Université Laval. (Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  3. Varain, L. (2013) Transformation avec la bactérie Agrobacterium tumefaciens de deux Ascomycètes Septoria musiva et Septoria populicola, agents phytopathogènes du peuplier. Master's thesis, Université Laval. (Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  4. Djeugap Fovo, Joseph (2013) Contraintes de germination et diagnostic moléculaire des champignons associés aux maladies chez Ricinodendron heudelotii au Cameroun. PhD thesis, Université Laval. (Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  5. Vialle, A. (2011) Entre code-barres génétiques et reconnaisance phylogénétique, clarification de la systématique des espèces responsables de la rouille du peuplier (Melampsora spp). PhD thesis, Université Laval. (URL  | Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  6. Plourde, K. (2010) L'utilisation de la mutagénèse insertionnelle afin d'identifier des gènes procurant un avantage parasitaire au champignon "Ophiostoma novo-ulmi subsp. novo-ulmi", agent de la maladie hollandaise de l'orme. PhD thesis, Université Laval. (URL  | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  7. Aoun, M. (2009) Une analyse histopathologique et génomique d'une interaction in vitro entre Ulmus americana et Ophiostoma novo-ulmi. PhD thesis, Université Laval. (URL  | Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  8. Beaulieu, M.-E. (2007) Caractérisation moléculaire des champignons ophiostomatoïdes associés à quatre espèces de scolytes de l'écorce colonisant l'épinette blanche au Québec et phylogénie multigénique d'une nouvelle espèce de Leptographium. Master's thesis, Université Laval. (PDF  | Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  9. Bouvet, G. (2007) Caractérisations et impacts des transposons à ADN chez Ophiostoma ulmi et O. novo-ulmi, principaux agents de la maladie hollandaise de l'orme. PhD thesis, Université Laval. (PDF  | Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  10. Morin, C. (2006) Étude du potentiel d'une souche albinos de Ceratocystis resinifera pour la protection biologique du bois contre le bleuissement. PhD thesis, Université Laval. (PDF  | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  11. Majeau, J.-A. (2005) Identification de séquences génomiques avoisinant un gène impliqué dans la pathogénécité et protéines candidates pouvant être codées par cette région, chez le champignon Ophiostoma novo-ulmi. Master's thesis, Université Laval. (URL  | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  12. Joly, D. (2005) Analyse de la diversité génomique des populations de Cronartium ribicola, agent responsable de la rouille vésiculeuse du pin blanc. Master's thesis, Université Laval. (URL  | Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  13. Allaire, M. (2005) Diversité fonctionnelle des Pseudomonas producteurs d'antibiotiques dans les rhizosphères de conifères en pépinières et en milieu naturel. Master's thesis, Université Laval. (URL  | Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  14. Feau, N. (2005) Relations intra et interspécifiques chez Mycosphaerella populorum (anamorphe septoria musiva) agent pathogène des peupliers. PhD thesis, Université Laval. (URL  | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  15. Grondin, J. (2004) Effet de phytohormones sur les réactions de défense de l'érable à sucre (Acer saccharum Marsh.) suite à l'entaillage et à d'autres types de blessure mécanique. Master's thesis, Université Laval. (URL  | Abstract | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  16. St-Michel, E. (2004) Identification et analyse de marqueurs génétiques diagnostiques de deux champignons de rouille des pins durs (Cronartium comptoniae et Peridermium harknessii) et identification d'un hyperparasite de ces rouilles au Québec. Master's thesis, Université Laval. (URL  | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  17. Cloutier, M. (2003) Caractérisation de la protéine kinase PNek1 et de la 14-3-3 P20-5 chez le peuplier. PhD thesis, Université Laval. (URL  | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  18. Okamba Ondzia, F. R. (2001) Diversité génétique des locus codants et structure génétique des populations du Cronartium ribicola nord-américaines. Master's thesis, Université Laval. (URL  | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  19. Germain, H. (2001) Étude moléculaire du champignon phytopathogène Ionotus tomentosus. Master's thesis, Université Laval. (URL  | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  20. Plante, F. (2001) Génétique de populations du champignon pathogène Nectria galligena dans le nord-est de l'Amérique du nord. PhD thesis, Université Laval. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  21. Bourassa, M. (2000) Épidémiologie moléculaire d'un champignon causant la rouille des feuilles du peuplier, Melampsora medusae f. sp deltoidae, en Amérique du Nord. Master's thesis, Université Laval. (URL  | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  22. Et-Touil, A. (2000) Étude génétique, biochimique et physiologique de la pathogénécité chez Ophiostoma novo-ulmi. Master's thesis, Université Laval. (URL  | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  23. Tanguay, P. (1999) Transformation génétique et détermination du caryotype électrophorétique du champignon phytopathogène Nectria galligena. Master's thesis, Université Laval. (URL  | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  24. Gagné, P. (1999) Variabilité génétique chez Ophiostoma piceae, agent de coloration de l'aubier, au Canada. Master's thesis, Université Laval. (URL  | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  25. Moungid, Z. (1998) Phæotheca dimorphospora : approche d'isolement et étude phylogénétique. Master's thesis, Université Laval. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  26. Reyes, I. (1998) Dissolution des phosphates minéraux par le champignon tropical Penicillium rugulosum : mécanismes d'action. PhD thesis, Université Laval. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  27. Goulet, A. (1998) Épidémiologie du champignon Chondrostereum purpureum, agent de maîtrise biologique de la reproduction végétative des feuillus de lumière en milieu forestier = Epidemiology of the fungus Chondrosterum purpureum, a biological control agent of the asexual reproduction of deciduous tree species in forest environment. Master's thesis, Université Laval. (URL  | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  28. Et-Touil, K. (1998) Structure génétique des populations du Cronartium ribicola canadiennes. Master's thesis, Université Laval. (URL  | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  29. Kaboré, K.B. (1997) Variabilité du Colletotrichum graminicola chez le sorgho (Sorghum bicolor) et lutte culturale contre l'anthracnose. PhD thesis, Université Laval. (URL  | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  30. Gosselin, L. (1996) Maîtrise biologique de la reproduction végétative chez des feuillus, dispersion et variabilité génétique de l'agent microbien impliqué, Chondrostereum purpureum. PhD thesis, Université Laval. (URL  | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  31. Dewar, K. (1995) Physical characterization of genome structure in Ophiostoma ulmi (Sensu lato). PhD thesis, Université Laval. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  32. Plante, D. (1995) Analyse génétique et biochimique de la virulence chez Nectria galligena. Master's thesis, Université Laval. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )


Non peer-reviewed articles


  1. Cogliastro, A., Bouchard, A., Domon, G. and Bernier, L. (2008) Les hauts et les bas de la forêt feuillue : sommes-nous prêts pour un nouveau changement de paysage? Options politiques, 29:58-61. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )


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Jérémie Alluard (2016) Les statistiques au moments de la rédaction 

  • Ce document a pour but de guider les étudiants à intégrer de manière appropriée une analyse statistique dans leur rapport de recherche.

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