Bouvet2007

Reference

Bouvet, G. (2007) Caractérisations et impacts des transposons à ADN chez Ophiostoma ulmi et O. novo-ulmi, principaux agents de la maladie hollandaise de l'orme. PhD thesis, Université Laval. (PDF )

Abstract

Des éléments mobiles de type 2 ont été mis en évidence chez Ophiostoma ulmi et O. novo-ulmi, agents pathogènes de la maladie hollandaise de l’orme. Dans un premier temps, ces transposons à ADN, nommés OPHIO1, OPHIO2 et OPHIO3, ont été subséquemment caractérisés, tant au niveau structural qu’au niveau de leur répartition dans les espèces concernées. L’étude approfondie de leur séquence a permis de faire ressortir des mutations particulières de type RIP (Repeat induced point mutations) uniquement présentes chez OPHIO3. Ces dernières, ont par ailleurs, permis de mettre au point une nouvelle technique de visualisation de ce type de mutations (CTS visualization), applicable à l’ensemble de ces éléments mobiles. Dans un second temps, la mobilité d’OPHIO1 et OPHIO2 a fait l’objet d’une étude détaillée. Grâce à divers stress abiotiques, nous avons démontré que ces éléments sont mobiles au sein des génomes des champignons responsables de la maladie hollandaise de l’orme. En dernier lieu, des analyses bioinformatiques ont permis de mettre en évidence des zones de sélection positive au sein de domaines précis des transposases, l’enzyme requise pour la mobilité d’OPHIO1 et d’OPHIO2. L’ensemble de ces résultats a permis d’accroître la connaissance des TE ainsi que d’essayer de comprendre la dynamique complexe existant entre les transposons et leurs génomes hôtes.

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@PHDTHESIS { Bouvet2007,
    AUTHOR = { Bouvet, G. },
    TITLE = { Caractérisations et impacts des transposons à ADN chez Ophiostoma ulmi et O. novo-ulmi, principaux agents de la maladie hollandaise de l'orme },
    SCHOOL = { Université Laval },
    YEAR = { 2007 },
    TYPE = { PhD },
    NOTE = { CEFTMS, Bernier, L. },
    ABSTRACT = { Des éléments mobiles de type 2 ont été mis en évidence chez Ophiostoma ulmi et O. novo-ulmi, agents pathogènes de la maladie hollandaise de l’orme. Dans un premier temps, ces transposons à ADN, nommés OPHIO1, OPHIO2 et OPHIO3, ont été subséquemment caractérisés, tant au niveau structural qu’au niveau de leur répartition dans les espèces concernées. L’étude approfondie de leur séquence a permis de faire ressortir des mutations particulières de type RIP (Repeat induced point mutations) uniquement présentes chez OPHIO3. Ces dernières, ont par ailleurs, permis de mettre au point une nouvelle technique de visualisation de ce type de mutations (CTS visualization), applicable à l’ensemble de ces éléments mobiles. Dans un second temps, la mobilité d’OPHIO1 et OPHIO2 a fait l’objet d’une étude détaillée. Grâce à divers stress abiotiques, nous avons démontré que ces éléments sont mobiles au sein des génomes des champignons responsables de la maladie hollandaise de l’orme. En dernier lieu, des analyses bioinformatiques ont permis de mettre en évidence des zones de sélection positive au sein de domaines précis des transposases, l’enzyme requise pour la mobilité d’OPHIO1 et d’OPHIO2. L’ensemble de ces résultats a permis d’accroître la connaissance des TE ainsi que d’essayer de comprendre la dynamique complexe existant entre les transposons et leurs génomes hôtes. },
    OWNER = { gagnea },
    TIMESTAMP = { 2007.12.12 },
    URL = { http://www.cef-cfr.ca/uploads/Publications/Bouvet2007.pdf },
}

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