Patrick James

Chercheur régulier
Écologie spatiale et modélisation
Université de Montréal
Département des Sciences biologiques
Pavillon Marie-Victorin
C.P. 6128, succursale Centre-ville
Montréal (Québec)
H3C 3J7 Canada

Téléphone : 514 343-6864
Laboratoire : 514 343-6111 poste 1304

Page départementale 

Marion Germain
Louis-Etienne Robert
Julie Marleau

Directions d'étudiants

Simon Legault
Julian Wittische
Paul Mayrand
Olivier Pontbriand-Paré
Jennifer Sauri


Mathieu Landry
Melbert Schwarz
Ancien personnel
Colin Garroway (Postdoc 2016)
Mathieu Neau (Prof. de rech. 2016)

Étudiants diplômés
  • Post-Doc. University of Alberta, 2011
  • Ph.D. Faculty of Forestry (University of Toronto, Canada). 2009
  • B.Sc. (Honours), Department of Zoology (University of Toronto, Canada). 2002

Research in our lab examines the role of spatial heterogeneity on spatial processes with particular emphasis on forest disturbance dynamics. Spatial heterogeneity generally refers to the composition and configuration of forest stands or regions that are composed of groups of trees of different ages or species. Forest disturbances such as fire, insect outbreaks, and logging (i.e., forest management) create distinct spatial patterns in forest ecosystems that either alone, or in combination, can have significant economic and ecological consequences. Within a landscape ecology framework and using tools such as spatial statistical analysis, simulation models, and landscape genetics, we investigate the role of spatial heterogeneity on broad-scale forest dynamics and their consequences for conservation.

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Chapitres de livre

  1. Doyon, F., Sturtevant, B.R., Papaik, M., Fall, A., Miranda, B., Kneeshaw, D.D., Messier, C., Fortin, M.-J. and James, P.M.A. (2012) Assessing knowledge ambiguity in the creation of a model based on expert knowledge and comparison with the results of a landscape succession model in central Labrador. (Chap. 10) In Expert Knowledge and its Application in Landscape Ecology. (Perera, A.H. and Drew, C.A. and Johnson, C.J., Eds.) Springer, pages 189-210. (URL  | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )

Livres et actes de colloques publiés à titre d'éditeur

Articles publiés dans des revues avec comité de lecture

  1. James, P.M.A., Janes, J.K., Roe, A.D. and Cooke, B.J. (2016) Modeling Landscape-Level Spatial Variation in Sex Ratio Skew in the Mountain Pine Beetle (Coleoptera: Curculionidae). Environmental Entomology, 45(4):790-801. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  2. James, P.M.A., Cooke, B., Brunet, B.M.T., Lumley, L.M., Sperling, F.A.H., Fortin, M.-J., Quinn, V.S. and Sturtevant, B.R. (2015) Life-stage differences in spatial genetic structure in an irruptive forest insect: Implications for dispersal and spatial synchrony. Molecular Ecology, 24(2):296-309. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  3. Maguire, D.Y., James, P.M.A., Buddle, C.M. and Bennett, E.M. (2015) Landscape connectivity and insect herbivory: A framework for understanding tradeoffs among ecosystem services. Global Ecology and Conservation, 4:73-84. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  4. Sturtevant, B.R., Miranda, B.R., Wolter, P.T., James, P.M.A., Fortin, M.-J. and Townsend, P.A. (2014) Forest recovery patterns in response to divergent disturbance regimes in the Border Lakes region of Minnesota (USA) and Ontario (Canada). Forest Ecology and Management, 313:199-211. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  5. Burke, A., Levavasseur, G., James, P.M.A., Guiducci, D., Izquierdo, M.A., Bourgeon, L., Kageyama, M., Ramstein, G. and Vrac, M. (2014) Exploring the impact of climate variability during the Last Glacial Maximum on the pattern of human occupation of Iberia. Journal of Human Evolution, 73:35-46. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  6. Cullingham, C.I., James, P.M.A., Cooke, J.E.K. and Coltman, D.W. (2012) Characterizing the physical and genetic structure of the lodgepole pine Ã-- jack pine hybrid zone: Mosaic structure and differential introgression. Evolutionary Applications, 5(8):879-891. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  7. Fortin, M.-J., James, P.M.A., MacKenzie, A., Melles, S.J. and Rayfield, B. (2012) Spatial statistics, spatial regression, and graph theory in ecology. Spatial Statistics, 1:100-109. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  8. Gayathri Samarasekera, G.D., Bartell, N.V., Lindgren, B.S., Cooke, J.E.K., Davis, C.S., James, P.M.A., Coltman, D.W., Mock, K.E. and Murray, B.W. (2012) Spatial genetic structure of the mountain pine beetle (Dendroctonus ponderosae) outbreak in western Canada: Historical patterns and contemporary dispersal. Molecular Ecology, 21(12):2931-2948. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  9. James, P.M.A., Fortin, M.-J., Sturtevant, B.R., Fall, A. and Kneeshaw, D.D. (2011) Modelling Spatial Interactions Among Fire, Spruce Budworm, and Logging in the Boreal Forest. Ecosystems, 14(1):60-75. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  10. James, P.M.A., Coltman, D.W., Murray, B.W., Hamelin, R.C. and Sperling, F.A.H. (2011) Spatial genetic structure of a symbiotic beetle-fungal system: Toward multi-taxa integrated landscape genetics. PLoS ONE, 6(10):e25359. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  11. James, P.M.A., Sturtevant, B.R., Townsend, P., Wolter, P. and Fortin, M.-J. (2011) Two-dimensional wavelet analysis of spruce budworm host basal area in the Border Lakes landscape. Ecological Applications, 21(6):2197-2209. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  12. Roe, A.D., James, P.M.A., Rice, A.V., Cooke, J.E.K. and Sperling, F.A.H. (2011) Spatial Community Structure of Mountain Pine Beetle Fungal Symbionts Across a Latitudinal Gradient. Microbial Ecology, 62(2):347-360. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  13. James, P.M.A., Fleming, R.A. and Fortin, M.-J. (2010) Identifying significant scale-specific spatial boundaries using wavelets and null models: Spruce budworm defoliation in Ontario, Canada as a case study. Landscape Ecology, 25(6):873-887. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  14. Anderson, C.D., Epperson, B.K., Fortin, M.-J., Holderegger, R., James, P.M.A., Rosenberg, M.S., Scribner, K.T. and Spear, S. (2010) Considering spatial and temporal scale in landscape-genetic studies of gene flow. Molecular Ecology, 19(17):3565-3575. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  15. Epperson, B.K., McRae, B.H., Scribner, K., Cushman, S.A., Rosenberg, M.S., Fortin, M.-J., James, P.M.A., Murphy, M., Manel, S., Legendre, P. and Dale, M.R.T. (2010) Utility of computer simulations in landscape genetics. Molecular Ecology, 19(17):3549-3564. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  16. Rayfield, B., James, P.M.A., Fall, A. and Fortin, M.-J. (2008) Comparing static versus dynamic protected areas in the Québec boreal forest. Biological Conservation, 141(2):438-449. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  17. James, P.M.A., Fortin, M.-J., Fall, A., Kneeshaw, D.D. and Messier, C. (2007) The effects of spatial legacies following shifting management practices and fire on boreal forest age structure. Ecosystems, 10(8):1261-1277. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  18. James, P.M.A., Rayfield, B., Fortin, M.-J., Fall, A. and Farley, G. (2005) Reserve network design combining spatial graph theory and species' spatial requirements. Geomatica, 59(3):323-333. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )

Articles publiés dans des actes de colloque (proceedings)

Rapports scientifiques, manuels et autres

  1. Craven D., Angers, V.-A., Filotas, E., Tittler, R., Desrochers, M., James, P.M.A. and Messier, C. (2013) L'aménagement écosystémique de forêts privées du Centre-du-Québec dans le contexte des changements globaux. Technical report, Agence Forestière des Bois-Francs. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )

Thèses, mémoires et essais

  1. James, P.M.A. (2009) Interacting disturbances in the boreal forest and the importance of spatial legacies at multiple scales. Thèse de doctorat, University of Toronto. (Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )

Thèses, mémoires et essais supervisés

Articles publiés dans des revues sans comité de lecture

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11e Colloque
du CEF

1 et 2
mai 2017

Coeur des sciences de l'UQAM

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25-26 mai | Université Laval

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Introduction aux systèmes d'information géographique avec QGIS
20-22 mars 2017 | Univ. Laval

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Cours du CEF

Analyse des pistes et modélisation par équations structurelles pour écologistes 
1–5 mai 2017 | Université de Sherbrooke
Path analysis and structural equation modelling for ecologists 
May 1–5 2017 | Université de Sherbrooke
Cours d'été: Terrain avancé en environnement (GÉO 6041) 
Cours aux cycles supérieurs de 3 crédits offert par François Girard, du 2 au 7 juillet 2017 à la Forêt Montmorency non loin de Québec.
Cours d’été en statistiques bayésiennes – Summer school in Bayesian statistics 
École d’été en statistiques bayésiennes. Maximum de 20 participants.
14 au 18 août | Orford Musique (à 30 minutes de Sherbrooke)
Cours sur la complexité 
24-29 septembre 2017, Toscane, Italie

********************************************************** ***************** Maudite pub - Budworm ****************** **********************************************************

********************************************************** ***************** Maudite pub - Colibri **************************** **********************************************************

********************************************************** ***************** Maudite pub - NewForest **************************** **********************************************************

********************************************************** ********** Maudite pub 6 - Au coeur de l'arbre *********** **********************************************************

...Une exposition
virtuelle sur l'arbre!

********************************************************** ***************** Boîte à trucs *************** **********************************************************

La référence vedette !

Jérémie Alluard (2016) Les statistiques au moments de la rédaction 

  • Ce document a pour but de guider les étudiants à intégrer de manière appropriée une analyse statistique dans leur rapport de recherche.

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